More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0293 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  37.62 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  38.6 
 
 		 352 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  33.48 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  45.87 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 244 aa  101  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.82 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  42 
 
 		 363 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  54.9 
 
 		 415 aa  99.4  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  44.04 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  44.04 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  44.04 
 
 		 219 aa  98.2  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 242 aa  97.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  42.2 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  47.22 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 454 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  38.82 
 
 		 239 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  41.28 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  46.56 
 
 		 330 aa  95.1  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  39.16 
 
 		 319 aa  94.7  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  44.25 
 
 		 319 aa  94.4  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  44.25 
 
 		 319 aa  94.4  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  43.24 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  49.06 
 
 		 345 aa  94  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  46.6 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  41.8 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  35.25 
 
 		 466 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  34.53 
 
 		 468 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 		 345 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  36.65 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  39.06 
 
 		 459 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  39.52 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  48.51 
 
 		 294 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  47.57 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  50 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  38.28 
 
 		 459 aa  89.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  43.1 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  48.54 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  46.08 
 
 		 346 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  46.08 
 
 		 346 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  46.08 
 
 		 346 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  46.08 
 
 		 346 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  46.08 
 
 		 365 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  46.08 
 
 		 354 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  46.08 
 
 		 346 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  47.22 
 
 		 481 aa  87.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  46.08 
 
 		 350 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 		 166 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  46.6 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  44.23 
 
 		 319 aa  87  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.88 
 
 		 447 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  32.9 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  46.6 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  45.1 
 
 		 369 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  47.27 
 
 		 175 aa  86.7  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  47.22 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  46.6 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  45.63 
 
 		 344 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  45.63 
 
 		 260 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  33.5 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  45.63 
 
 		 344 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  46.81 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  38.98 
 
 		 195 aa  85.5  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  46.6 
 
 		 263 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1813  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.12 
 
 		 185 aa  85.5  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  31.1 
 
 		 188 aa  85.5  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  45.37 
 
 		 607 aa  85.5  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  46.32 
 
 		 358 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  45.63 
 
 		 344 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  44.64 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  46.6 
 
 		 263 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  44.12 
 
 		 369 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  46.32 
 
 		 358 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 344 aa  85.1  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  44.12 
 
 		 371 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  44.66 
 
 		 345 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  45.1 
 
 		 358 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 		 264 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  46.15 
 
 		 337 aa  84.7  9e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.86 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  35.86 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  46.96 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  46.08 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  39.71 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  44.44 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  43.69 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  40.54 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.1 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  42.86 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  46.6 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  45.63 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  46.6 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>