131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0290 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 161 aa  308  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.42 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.84 
 
 		 154 aa  98.2  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  39.47 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.63 
 
 		 217 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.26 
 
 		 196 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.76 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.11 
 
 		 195 aa  91.3  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.31 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  37.5 
 
 		 157 aa  87.4  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.5 
 
 		 215 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.55 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.71 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.89 
 
 		 191 aa  85.5  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.45 
 
 		 202 aa  84.7  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  36.36 
 
 		 167 aa  84.7  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  34.59 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  34.59 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.17 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.17 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.17 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  35.37 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  33.33 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.13 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.84 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  34.76 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.41 
 
 		 196 aa  80.9  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.31 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.5 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.35 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.29 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.62 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  32.28 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  33.96 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1039  fxsA protein  40.16 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.74 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  48.35 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.71 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.8 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.11 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  42.55 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.83 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.48 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  34.12 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1359  FxsA  38.51 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00729111  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  37.27 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  37.27 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  37.27 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  37.27 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  37.27 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  31.33 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  31.52 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  32.14 
 
 		 181 aa  70.5  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.14 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4365  FxsA  38.51 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403503  normal  0.04543 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1295  fxsA cytoplasmic membrane protein  27.16 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.58003  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  31.18 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.72 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  31.18 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.97 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4490  FxsA  37.84 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00316913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  37.4 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.17 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.17 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  36.92 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.17 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  30.29 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.66 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  50.7 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1845  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.78 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.17 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4379  cytoplasmic membrane family protein  37.32 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.45 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.25 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4267  FxsA  33.96 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.6 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.33 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1238  putative FxsA cytoplasmic membrane protein  38.06 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2899  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.06 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.09 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04010  inner membrane protein  37.5 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3852  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.5 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  34 
 
 		 129 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03972  hypothetical protein  37.5 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3462  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.66 
 
 		 155 aa  62  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.21312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  32.11 
 
 		 151 aa  62  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4381  FxsA  37.5 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4695  FxsA  37.5 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3872  FxsA  37.5 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4669  FxsA  37.5 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  33 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  33 
 
 		 129 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  37.5 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.14 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  33 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4503  FxsA  35.97 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329001  decreased coverage  0.000252852 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0327  FxsA  37.74 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.54 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0008  hypothetical protein  34.15 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4074  FxsA  35.92 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.283215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>