More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0100 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0100  diguanylate cyclase  100 
 
 
446 aa  886  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.246337  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0076  diguanylate cyclase  71.49 
 
 
444 aa  591  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  32.73 
 
 
722 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3137  response regulator receiver protein  41.01 
 
 
319 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3550  diguanylate cyclase  41.74 
 
 
559 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953301  normal  0.354246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0532  GGDEF domain-containing protein  40.45 
 
 
321 aa  144  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3752  diguanylate cyclase  48.3 
 
 
436 aa  142  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2999  diguanylate cyclase  33.09 
 
 
548 aa  142  1e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3512  diguanylate cyclase  41.62 
 
 
318 aa  142  1e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3583  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.38 
 
 
322 aa  141  2e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864033 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  48.19 
 
 
555 aa  142  2e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3414  diguanylate cyclase  30.43 
 
 
444 aa  142  2e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2045  diguanylate cyclase  47.34 
 
 
243 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2151  diguanylate cyclase  37.75 
 
 
583 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.984421  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6727  diguanylate cyclase  42.25 
 
 
467 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  44.75 
 
 
563 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4748  diguanylate cyclase  44.04 
 
 
377 aa  137  3e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0470  GGDEF  41.03 
 
 
412 aa  137  3e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.606028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  44.64 
 
 
307 aa  137  3e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3459  diguanylate cyclase  39.53 
 
 
324 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2297  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  31.83 
 
 
422 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0251  diguanylate cyclase  36.65 
 
 
660 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696506  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  41.28 
 
 
405 aa  136  6e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1802  diguanylate cyclase  42.86 
 
 
263 aa  135  1e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0392  diguanylate cyclase  38.2 
 
 
319 aa  135  1e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0549299  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0571  diguanylate cyclase  39.53 
 
 
324 aa  135  1e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0570  diguanylate cyclase  39.53 
 
 
324 aa  135  1e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  44.75 
 
 
1004 aa  135  1e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0655  diguanylate cyclase  41.57 
 
 
172 aa  135  1e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  7.25118e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  41.54 
 
 
721 aa  135  1e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2531  diguanylate cyclase  36.89 
 
 
347 aa  135  1e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.204125  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4948  sensory box protein  33.81 
 
 
921 aa  135  2e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.42 
 
 
730 aa  135  2e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0319  two component diguanylate cyclase  40.1 
 
 
661 aa  135  2e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0198  diguanylate cyclase  40.33 
 
 
312 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0452  diguanylate cyclase  38.8 
 
 
323 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  31.97 
 
 
569 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3374  diguanylate cyclase  43.98 
 
 
492 aa  134  4e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3794  diguanylate cyclase  38.8 
 
 
328 aa  134  4e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.807786  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.8 
 
 
772 aa  134  4e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.32 
 
 
314 aa  134  4e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0204  diguanylate cyclase  37.08 
 
 
453 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.209858  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0531  diguanylate cyclase  40.7 
 
 
328 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.842524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3737  diguanylate cyclase  40.7 
 
 
328 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251056  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3920  diguanylate cyclase  40.7 
 
 
328 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00763336  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  42.86 
 
 
321 aa  133  7e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4329  diguanylate cyclase  37.29 
 
 
320 aa  133  8e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.406414  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  39.81 
 
 
638 aa  133  8e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2588  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.71 
 
 
710 aa  132  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0652312  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4028  diguanylate cyclase  33.74 
 
 
447 aa  132  1e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0645  GGDEF domain-containing protein  43.68 
 
 
454 aa  132  1e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3647  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.09 
 
 
359 aa  132  1e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745021  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  39.35 
 
 
342 aa  132  1e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.32 
 
 
642 aa  132  1e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3306  diguanylate cyclase  39.53 
 
 
324 aa  132  1e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198506  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4119  diguanylate cyclase  42.78 
 
 
382 aa  132  1e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898336 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0508  GGDEF domain-containing protein  43.68 
 
 
454 aa  132  1e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.16 
 
 
901 aa  132  1e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  3.51362e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1449  diguanylate cyclase  43.68 
 
 
466 aa  132  2e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1222  GGDEF domain-containing protein  43.68 
 
 
466 aa  132  2e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1418  diguanylate cyclase  43.68 
 
 
466 aa  132  2e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2824  GGDEF domain-containing protein  43.68 
 
 
628 aa  131  2e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3066  GGDEF domain-containing protein  43.68 
 
 
466 aa  132  2e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2834  diguanylate cyclase  37.27 
 
 
355 aa  132  2e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15225  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.06 
 
 
632 aa  131  2e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2731  diguanylate cyclase  41.52 
 
 
714 aa  132  2e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1551  GGDEF domain-containing protein  43.68 
 
 
466 aa  132  2e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03006  hypothetical protein  40.39 
 
 
520 aa  131  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  39.51 
 
 
354 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0569  sensory box/GGDEF family protein  40.12 
 
 
324 aa  131  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  43.72 
 
 
457 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  42.86 
 
 
457 aa  130  4e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.45 
 
 
457 aa  130  4e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1895  diguanylate cyclase  38.69 
 
 
555 aa  130  4e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1719  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.18 
 
 
563 aa  130  4e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  38.01 
 
 
417 aa  130  5e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3625  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.83 
 
 
322 aa  130  5e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.83 
 
 
322 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457648  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.26 
 
 
1073 aa  130  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2077  diguanylate cyclase  45.96 
 
 
382 aa  130  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.793636  normal  0.406002 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  37.78 
 
 
354 aa  129  7e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1927  diguanylate cyclase  43.86 
 
 
253 aa  129  7e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.949533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  44 
 
 
732 aa  130  7e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.2 
 
 
505 aa  129  8e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0719  diguanylate cyclase  43.27 
 
 
370 aa  129  8e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.67 
 
 
312 aa  129  9e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.174701  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  35.19 
 
 
1099 aa  129  9e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.71 
 
 
407 aa  129  9e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6003  diguanylate cyclase  44.71 
 
 
371 aa  129  1e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753958  normal  0.321238 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0304  diguanylate cyclase  37.72 
 
 
464 aa  129  1e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6958  diguanylate cyclase  46.2 
 
 
502 aa  129  1e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  38.16 
 
 
631 aa  129  1e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1977  membrane associated GGDEF protein  38.2 
 
 
583 aa  129  1e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0402  diguanylate cyclase  39.9 
 
 
866 aa  129  1e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362695  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1014  diguanylate cyclase  39.09 
 
 
552 aa  129  1e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.737518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0798  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.79 
 
 
622 aa  129  1e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.131749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3381  diguanylate cyclase  38.65 
 
 
622 aa  129  1e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3903  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  37.04 
 
 
628 aa  129  1e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  34.93 
 
 
517 aa  129  1e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4041  diguanylate cyclase  43.71 
 
 
282 aa  129  1e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0649407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>