297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0097 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0769  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.75 
 
 
933 aa  946  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1693  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  42.36 
 
 
921 aa  678  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326952 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1721  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.97 
 
 
951 aa  979  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3607  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.19 
 
 
1006 aa  763  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0522268 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0803  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52 
 
 
963 aa  919  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4190  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  47.23 
 
 
920 aa  776  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133168  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1430  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.97 
 
 
954 aa  981  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0998  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  49.84 
 
 
956 aa  919  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.162331  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2884  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  51.44 
 
 
950 aa  943  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.554581 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0889  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.33 
 
 
963 aa  925  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.315483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2164  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.2 
 
 
986 aa  762  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668093  normal  0.0814418 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1484  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  53.08 
 
 
954 aa  983  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0724097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1837  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  50.59 
 
 
940 aa  934  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.343692  normal  0.0435988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0922  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.92 
 
 
995 aa  755  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.178538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3512  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  54.17 
 
 
943 aa  976  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679616 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0738  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.33 
 
 
933 aa  944  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0645  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.33 
 
 
933 aa  944  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1640  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  53.06 
 
 
953 aa  979  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.337584  normal  0.0829235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0704  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  48.19 
 
 
896 aa  758  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0829  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.69 
 
 
939 aa  732  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.635119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01875  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  51.4 
 
 
939 aa  941  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0131878  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0892  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.75 
 
 
933 aa  946  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.349093  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0859  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.75 
 
 
933 aa  946  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0273322  hitchhiker  0.00122332 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0795  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.75 
 
 
933 aa  947  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0976096  normal  0.0357723 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2630  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  51.18 
 
 
943 aa  898  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2010  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  51.01 
 
 
942 aa  934  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0184  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.17 
 
 
985 aa  748  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1635  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.43 
 
 
901 aa  724  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0550573  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1377  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  49.95 
 
 
943 aa  918  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.850315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1584  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.21 
 
 
1009 aa  747  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01198  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  51.35 
 
 
942 aa  911  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1097  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  51.93 
 
 
954 aa  954  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00360454  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2120  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.47 
 
 
949 aa  806  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2930  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.33 
 
 
933 aa  944  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2968  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.34 
 
 
935 aa  955  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0231  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.74 
 
 
987 aa  756  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1532  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.6 
 
 
953 aa  672  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00682538  normal  0.0204532 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0594  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  48.87 
 
 
934 aa  868  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0156  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.07 
 
 
984 aa  767  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1454  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45 
 
 
1083 aa  801  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2881  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.34 
 
 
935 aa  955  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0829  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.41 
 
 
940 aa  718  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.196353  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0961  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.59 
 
 
958 aa  663  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0933  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.13 
 
 
1001 aa  751  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2508  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  51.29 
 
 
943 aa  953  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00264339  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1228  alpha-ketoglutarate decarboxylase  47.67 
 
 
1287 aa  721  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.898222  normal  0.0783656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3689  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  53.74 
 
 
938 aa  972  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2800  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  53.66 
 
 
945 aa  965  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307679  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2941  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.55 
 
 
998 aa  771  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196108  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11274  alpha-ketoglutarate decarboxylase  44.22 
 
 
1231 aa  712  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0466625 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0266  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  51.6 
 
 
958 aa  958  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01355  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.48 
 
 
941 aa  960  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0773  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.33 
 
 
933 aa  944  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3760  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  54.71 
 
 
943 aa  982  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0361197  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1166  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.58 
 
 
955 aa  661  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1646  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.15 
 
 
996 aa  751  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.44941 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1384  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.34 
 
 
935 aa  955  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.761242  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1559  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  48.87 
 
 
934 aa  868  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1747  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.97 
 
 
954 aa  984  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3493  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  49.79 
 
 
959 aa  914  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2628  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  51.29 
 
 
943 aa  952  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107234  normal  0.0949713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4070  alpha-ketoglutarate decarboxylase  50.29 
 
 
1237 aa  764  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.102403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2883  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.05 
 
 
987 aa  727  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.684805  normal  0.693024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0984  alpha-ketoglutarate decarboxylase  48.57 
 
 
1240 aa  694  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0719741  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1788  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  50.7 
 
 
940 aa  931  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1267  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.76 
 
 
937 aa  962  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209751  normal  0.0974265 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2814  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  50.54 
 
 
940 aa  931  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0752  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.33 
 
 
933 aa  944  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3396  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.26 
 
 
951 aa  668  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177532  normal  0.434505 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02000  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  40.56 
 
 
920 aa  706  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.995655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2370  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  47.38 
 
 
1220 aa  754  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.604296  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004112  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.48 
 
 
941 aa  964  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1883  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  45.18 
 
 
1308 aa  707  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814952  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4994  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  47.21 
 
 
952 aa  777  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3100  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  52.67 
 
 
935 aa  954  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1796  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.02 
 
 
950 aa  654  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1428  alpha-ketoglutarate decarboxylase  46.37 
 
 
1313 aa  719  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.44598  normal  0.8951 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1806  alpha-ketoglutarate decarboxylase  47.95 
 
 
1258 aa  747  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19420  alpha-ketoglutarate decarboxylase  48.48 
 
 
1317 aa  771  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.673379  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18450  alpha-ketoglutarate decarboxylase  47.17 
 
 
1303 aa  744  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0618505  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1738  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.25 
 
 
923 aa  726  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30580  alpha-ketoglutarate decarboxylase  46.26 
 
 
1251 aa  710  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303495  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6840  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.38 
 
 
916 aa  705  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.631484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6126  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  42.55 
 
 
922 aa  721  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7565  alpha-ketoglutarate decarboxylase  48.29 
 
 
1131 aa  734  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258386  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3675  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  48.33 
 
 
1229 aa  758  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09540  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  48.61 
 
 
1283 aa  741  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1943  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  46.49 
 
 
919 aa  771  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3681  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  50.06 
 
 
1219 aa  731  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2890  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  48.6 
 
 
1219 aa  744  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.313836  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1211  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  45.88 
 
 
1239 aa  726  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191294  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1219  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  48.39 
 
 
1250 aa  748  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.56639  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0622  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  44.44 
 
 
928 aa  757  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5146  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 subunit  46.2 
 
 
1225 aa  724  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.449932 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1534  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 subunit  44.83 
 
 
901 aa  734  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  8.64755e-05  normal  0.297089 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0097  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  100 
 
 
933 aa  1907  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.413523  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4170  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  48.71 
 
 
1294 aa  753  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1042  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  42.94 
 
 
1425 aa  647  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5027  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  43.6 
 
 
932 aa  749  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139273  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8284  alpha-ketoglutarate decarboxylase  49.47 
 
 
1241 aa  765  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341071  normal  0.729209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>