34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0095 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  100 
 
 
176 aa  359  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3212  hypothetical protein  69.23 
 
 
176 aa  210  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  62.41 
 
 
177 aa  184  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  49.69 
 
 
161 aa  162  2e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1943  hypothetical protein  40.44 
 
 
168 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.862348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1515  hypothetical protein  32.86 
 
 
168 aa  76.3  2e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754044  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0504  hypothetical protein  29.2 
 
 
154 aa  75.9  3e-13  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  32.93 
 
 
145 aa  68.2  6e-11  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  31.41 
 
 
145 aa  63.9  1e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  33.54 
 
 
146 aa  60.8  1e-08  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  29.41 
 
 
154 aa  60.1  1e-08  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  30.87 
 
 
137 aa  54.7  6e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  25.6 
 
 
163 aa  52.8  2e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  28.86 
 
 
151 aa  52.4  3e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  28.86 
 
 
151 aa  52  4e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  28.22 
 
 
150 aa  51.2  8e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  29.55 
 
 
115 aa  50.4  1e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  29.01 
 
 
147 aa  50.4  1e-05  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  20.86 
 
 
151 aa  50.1  1e-05  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  25.74 
 
 
151 aa  49.3  3e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  29.93 
 
 
150 aa  48.9  3e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  27.33 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  26.47 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  28.68 
 
 
150 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  26.58 
 
 
152 aa  45.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  26.81 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  29.32 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0874  hypothetical protein  24.26 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100983  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  34.02 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  24.26 
 
 
147 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  38.6 
 
 
115 aa  42  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  25.19 
 
 
111 aa  42  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  31.63 
 
 
152 aa  40.8  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1760  Domain of unknown function DUF1791  29.91 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.172768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>