More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0093 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0093  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
567 aa  1121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0300  gamma-glutamyltransferase  66.05 
 
 
596 aa  671  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2148  gamma-glutamyltranspeptidase  57.93 
 
 
576 aa  573  1e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2654  gamma-glutamyltransferase 1  56.61 
 
 
553 aa  551  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0302654 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0769  gamma-glutamyltransferase  58.56 
 
 
557 aa  540  1e-152  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.303985  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0301  gamma-glutamyltransferase  50.09 
 
 
603 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00307  gamma-glutamyltransferase  49.55 
 
 
597 aa  483  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.777072  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1553  gamma-glutamyltransferase  50.54 
 
 
576 aa  481  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0610  hypothetical protein  50.55 
 
 
574 aa  466  1e-130  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0271  gamma-glutamyltransferase  50.18 
 
 
603 aa  468  1e-130  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.752949  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0591  hypothetical protein  50.37 
 
 
574 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03460  Gamma-glutamyltranspeptidase precursor  53.01 
 
 
567 aa  448  1e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170484  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0455  putative gamma-glutamyltranspeptidase precursor  50.71 
 
 
577 aa  441  1e-122  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04730  putative gamma-glutamyltranspeptidase precursor  52.03 
 
 
577 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  44.2 
 
 
599 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4193  gamma-glutamyltransferase  50.56 
 
 
552 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  44.37 
 
 
593 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  44.88 
 
 
617 aa  421  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  44.24 
 
 
590 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  45.14 
 
 
645 aa  421  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  44.77 
 
 
645 aa  421  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  45.65 
 
 
579 aa  415  1e-115  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  42.39 
 
 
581 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  45.94 
 
 
589 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  41.61 
 
 
556 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  42.57 
 
 
576 aa  406  1e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  41.25 
 
 
556 aa  408  1e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  43.32 
 
 
583 aa  406  1e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.29294e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  44.69 
 
 
581 aa  407  1e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  42.44 
 
 
582 aa  407  1e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  44.72 
 
 
578 aa  408  1e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  40.5 
 
 
579 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  44.32 
 
 
580 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  42.63 
 
 
583 aa  405  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  41.79 
 
 
587 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  42.96 
 
 
606 aa  400  1e-110  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  43.52 
 
 
575 aa  402  1e-110  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  42.8 
 
 
592 aa  401  1e-110  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  43.35 
 
 
575 aa  399  1e-110  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  42.65 
 
 
576 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  42.65 
 
 
576 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  41.13 
 
 
587 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  43.8 
 
 
586 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  42.01 
 
 
587 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  44.77 
 
 
586 aa  399  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  41.62 
 
 
587 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  41.8 
 
 
587 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  42 
 
 
579 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  41.82 
 
 
579 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  42.53 
 
 
597 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  41.82 
 
 
579 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  41.88 
 
 
579 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  41.82 
 
 
579 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  43.88 
 
 
576 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  43.8 
 
 
575 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  41.71 
 
 
578 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  42.09 
 
 
581 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  48.53 
 
 
583 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  42.2 
 
 
581 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0909  gamma-glutamyltransferase 1  43.88 
 
 
590 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.591211  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4506  gamma-glutamyltransferase  40.48 
 
 
560 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  44.6 
 
 
579 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  46.91 
 
 
586 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  42.02 
 
 
580 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  42.02 
 
 
580 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  41.83 
 
 
581 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  42.2 
 
 
580 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  45.16 
 
 
574 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  39.66 
 
 
579 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  45.11 
 
 
578 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  39.48 
 
 
579 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  42.02 
 
 
580 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  40.62 
 
 
583 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  44.37 
 
 
594 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  42.02 
 
 
580 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  42.02 
 
 
580 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  41.83 
 
 
580 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  41.83 
 
 
577 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  42.96 
 
 
588 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  42.02 
 
 
580 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  43.45 
 
 
583 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  42.02 
 
 
580 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  39.48 
 
 
579 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  44.17 
 
 
587 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  40.45 
 
 
583 aa  385  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  44.89 
 
 
578 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  40.62 
 
 
583 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  41.83 
 
 
580 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  40.62 
 
 
583 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  43.35 
 
 
589 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  41.18 
 
 
604 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  45.14 
 
 
588 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  43.41 
 
 
586 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  43.3 
 
 
577 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4652  gamma-glutamyltransferase  42.68 
 
 
602 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467569  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  41 
 
 
583 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  43.6 
 
 
576 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  41.3 
 
 
571 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  45.09 
 
 
594 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5927  gamma-glutamyltransferase  42.7 
 
 
566 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.779153  normal  0.531425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>