37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0089 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  683  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  60.19 
 
 
339 aa  361  9e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  46.46 
 
 
326 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  45.23 
 
 
317 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  41.12 
 
 
332 aa  244  1e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  43.73 
 
 
337 aa  243  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.57372e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  48.32 
 
 
317 aa  238  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  47.75 
 
 
292 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  46.45 
 
 
310 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  47.47 
 
 
312 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  44.2 
 
 
314 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  40.57 
 
 
330 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.50461e-06 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  36.44 
 
 
347 aa  172  6e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  31.86 
 
 
322 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  35.12 
 
 
308 aa  163  5e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20370  hypothetical protein  48.15 
 
 
172 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3703  hypothetical protein  36.02 
 
 
224 aa  119  1e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3525  hypothetical protein  37.24 
 
 
244 aa  114  4e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  0.214556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3246  hypothetical protein  35.57 
 
 
244 aa  110  4e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310754  normal  0.875608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2447  hypothetical protein  36.08 
 
 
244 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2693  hypothetical protein  31.66 
 
 
231 aa  108  9e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1948  hypothetical protein  35.2 
 
 
267 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168356  hitchhiker  0.000258843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2426  hypothetical protein  32.16 
 
 
231 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  30.32 
 
 
188 aa  82  1e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  32.69 
 
 
223 aa  81.6  2e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0719  peptidase C39 bacteriocin processing  39.47 
 
 
164 aa  70.5  4e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  25.74 
 
 
164 aa  60.1  5e-08  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  8.35793e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2545  tetratricopeptide domain-containing protein  30.82 
 
 
672 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216986  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  30.97 
 
 
748 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 
627 aa  46.2  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
566 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
1451 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
1454 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
822 aa  43.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  34.34 
 
 
612 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0632  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
198 aa  42.7  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
927 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>