More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0085 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  100 
 
 
421 aa  867  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  78.57 
 
 
422 aa  632  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  72.79 
 
 
419 aa  591  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  57.8 
 
 
421 aa  514  1e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  58.03 
 
 
420 aa  512  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  56.12 
 
 
420 aa  488  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  54.81 
 
 
419 aa  486  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  55.12 
 
 
414 aa  478  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  55.37 
 
 
420 aa  478  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  54.88 
 
 
414 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  53.98 
 
 
418 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  52.88 
 
 
419 aa  472  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  56.25 
 
 
419 aa  469  1e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  53.73 
 
 
421 aa  466  1e-130  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  52.2 
 
 
420 aa  461  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  58.98 
 
 
418 aa  463  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  52.2 
 
 
420 aa  460  1e-128  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  49.28 
 
 
429 aa  401  1e-110  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  49.88 
 
 
417 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  49.64 
 
 
427 aa  391  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  51.45 
 
 
418 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  48.22 
 
 
424 aa  385  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  50.24 
 
 
418 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  43.61 
 
 
407 aa  341  1e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  48.08 
 
 
417 aa  332  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  42.48 
 
 
415 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  3.66711e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  43.97 
 
 
394 aa  329  5e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  43.53 
 
 
414 aa  329  5e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  44.89 
 
 
422 aa  328  1e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  44.2 
 
 
418 aa  325  8e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  44.66 
 
 
415 aa  322  8e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  45.36 
 
 
409 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  41.75 
 
 
415 aa  307  2e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.55584e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  41.38 
 
 
414 aa  303  5e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  39.26 
 
 
408 aa  275  1e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.05708e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  36.66 
 
 
400 aa  263  5e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  37.1 
 
 
404 aa  262  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  36.41 
 
 
400 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  35.4 
 
 
447 aa  241  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  36.83 
 
 
403 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  37.53 
 
 
404 aa  213  6e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  36.1 
 
 
403 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  31.88 
 
 
460 aa  209  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  36.2 
 
 
404 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  37.56 
 
 
404 aa  202  1e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  35.41 
 
 
402 aa  202  1e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  35.93 
 
 
406 aa  200  4e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  35.55 
 
 
405 aa  192  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  32.85 
 
 
404 aa  192  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  33.5 
 
 
406 aa  190  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  32.91 
 
 
378 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  31.56 
 
 
402 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  30.92 
 
 
388 aa  136  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  32.24 
 
 
340 aa  119  1e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  30.41 
 
 
348 aa  119  1e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  30.31 
 
 
360 aa  113  8e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  31.97 
 
 
344 aa  112  1e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  30.14 
 
 
341 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  31.29 
 
 
342 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  28.79 
 
 
341 aa  106  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  30.06 
 
 
372 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  31.15 
 
 
342 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 
370 aa  103  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  29.76 
 
 
341 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  28.62 
 
 
340 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  29.03 
 
 
341 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.2 
 
 
346 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  6.10364e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  30.72 
 
 
344 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  29.43 
 
 
365 aa  99.8  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  30.46 
 
 
359 aa  99.4  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  29.51 
 
 
341 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  30.43 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  29.1 
 
 
346 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  27.05 
 
 
343 aa  98.2  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  30.74 
 
 
373 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  37.57 
 
 
368 aa  97.1  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  30.09 
 
 
342 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 
342 aa  96.7  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  28.31 
 
 
341 aa  96.7  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.49 
 
 
445 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  28.53 
 
 
345 aa  96.3  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  26.13 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  28.83 
 
 
372 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  28.87 
 
 
365 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  34.76 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.05135e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  28.52 
 
 
366 aa  94.4  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  27.66 
 
 
345 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  30.4 
 
 
366 aa  93.6  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  28.95 
 
 
341 aa  93.2  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  27.44 
 
 
365 aa  93.2  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  28.57 
 
 
341 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  30.42 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  29.72 
 
 
369 aa  92  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  29.9 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  30.33 
 
 
367 aa  90.5  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  29.46 
 
 
368 aa  90.1  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.86 
 
 
429 aa  90.1  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0064  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.27 
 
 
438 aa  89.7  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  35.45 
 
 
364 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  28.46 
 
 
344 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>