85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0082 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  100 
 
 
323 aa  640  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  52.43 
 
 
320 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  52.1 
 
 
320 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  47.53 
 
 
332 aa  282  5e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  48.09 
 
 
324 aa  282  5e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  49.69 
 
 
320 aa  281  7e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  49.69 
 
 
320 aa  281  7e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  50.47 
 
 
323 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  47.02 
 
 
324 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  49.07 
 
 
320 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  49.53 
 
 
335 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  49.03 
 
 
320 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  46.06 
 
 
325 aa  270  3e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  46.42 
 
 
325 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  46.93 
 
 
320 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  45.31 
 
 
309 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  47.42 
 
 
331 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  47.42 
 
 
325 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  47.42 
 
 
325 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  47.1 
 
 
325 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  44.98 
 
 
306 aa  242  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  48.63 
 
 
303 aa  239  6e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  48.63 
 
 
303 aa  239  6e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  45.57 
 
 
312 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  42.09 
 
 
313 aa  234  1e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  41.08 
 
 
313 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  40.58 
 
 
316 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  46.3 
 
 
273 aa  208  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  47.51 
 
 
273 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  32.63 
 
 
333 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  31.8 
 
 
328 aa  135  1e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  30.53 
 
 
363 aa  112  1e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  42.65 
 
 
275 aa  82.8  7e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  38.85 
 
 
141 aa  82  1e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  38.46 
 
 
143 aa  80.5  3e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 
276 aa  71.2  2e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  38.76 
 
 
272 aa  70.5  3e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  41.04 
 
 
277 aa  68.9  1e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  40.44 
 
 
276 aa  68.9  1e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  36.03 
 
 
271 aa  68.9  1e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  34.4 
 
 
156 aa  68.6  1e-10  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  40.15 
 
 
276 aa  67.8  2e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  33.33 
 
 
146 aa  68.2  2e-10  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  37.86 
 
 
276 aa  67.8  3e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
287 aa  67  5e-10  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  40.91 
 
 
276 aa  65.9  8e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  33.82 
 
 
271 aa  65.9  9e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  39.69 
 
 
276 aa  65.9  1e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  32.79 
 
 
157 aa  64.7  2e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.08 
 
 
285 aa  65.1  2e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
281 aa  63.9  3e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
281 aa  63.9  3e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  35.77 
 
 
144 aa  63.9  3e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  31.97 
 
 
157 aa  63.9  4e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  31.97 
 
 
157 aa  63.9  4e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  35.54 
 
 
150 aa  63.5  5e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  33.61 
 
 
285 aa  61.2  2e-08  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  32.79 
 
 
152 aa  61.2  2e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  33.57 
 
 
143 aa  61.6  2e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  35.77 
 
 
273 aa  60.8  3e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  36.45 
 
 
272 aa  60.8  3e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  32.79 
 
 
182 aa  60.5  3e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  34.81 
 
 
297 aa  59.7  6e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  28.93 
 
 
288 aa  59.3  8e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  36.3 
 
 
276 aa  58.9  1e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  29.75 
 
 
152 aa  58.9  1e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  33.64 
 
 
139 aa  57.8  2e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  8.27491e-06 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  36.76 
 
 
276 aa  57.8  2e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  28.06 
 
 
140 aa  57.4  3e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  31.69 
 
 
205 aa  55.1  2e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  31.69 
 
 
205 aa  55.1  2e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  31.69 
 
 
205 aa  55.1  2e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  31.69 
 
 
205 aa  55.1  2e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  31.69 
 
 
205 aa  55.1  2e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5227  chromate resistance signal  50.98 
 
 
53 aa  53.9  3e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266795  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  31.69 
 
 
142 aa  54.3  3e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  32.23 
 
 
128 aa  54.3  3e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  33.05 
 
 
142 aa  52.8  8e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0096  hypothetical protein  34.78 
 
 
156 aa  51.6  2e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.806408  unclonable  8.44821e-06 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  29.51 
 
 
155 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1175  ChrB domain protein  26.85 
 
 
172 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105237  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1926  ChrB domain-containing protein  31.25 
 
 
196 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31129  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0965  ChrB domain-containing protein  28.26 
 
 
183 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4253  hypothetical protein  30 
 
 
171 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4139  ChrB domain-containing protein  26.76 
 
 
192 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>