More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0081 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 
450 aa  879  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  72.69 
 
 
446 aa  623  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  61.59 
 
 
453 aa  553  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  61.52 
 
 
456 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  61.07 
 
 
456 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  61.71 
 
 
455 aa  522  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  59.42 
 
 
454 aa  519  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  60.81 
 
 
450 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  61.26 
 
 
450 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  63.88 
 
 
445 aa  499  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  59.77 
 
 
447 aa  500  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  59.86 
 
 
444 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  59.87 
 
 
456 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  58.39 
 
 
456 aa  485  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  62.65 
 
 
447 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  63.21 
 
 
452 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  62.36 
 
 
457 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  62.22 
 
 
453 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  53.13 
 
 
442 aa  450  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0797  chromate transporter  57.63 
 
 
451 aa  448  1e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  56.35 
 
 
454 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2656  chromate transporter  55.19 
 
 
507 aa  385  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  45.59 
 
 
483 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  45.74 
 
 
469 aa  359  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  50.5 
 
 
463 aa  350  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  48.64 
 
 
467 aa  346  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.81 
 
 
441 aa  345  7e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  46.09 
 
 
466 aa  337  2e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.76 
 
 
469 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2389  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.91 
 
 
473 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443126  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2523  chromate transporter  46.43 
 
 
471 aa  329  5e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.600118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  48.14 
 
 
467 aa  328  9e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2724  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  48.76 
 
 
473 aa  326  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.25 
 
 
441 aa  326  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4736  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.07 
 
 
471 aa  325  8e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0153  chromate transporter  43.85 
 
 
466 aa  323  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.193683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.78 
 
 
469 aa  322  1e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  44.81 
 
 
461 aa  321  2e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0300  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.85 
 
 
467 aa  319  5e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  44.4 
 
 
462 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.67 
 
 
469 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  46.91 
 
 
460 aa  315  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.81 
 
 
465 aa  314  3e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  4.39073e-08 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  45.72 
 
 
443 aa  313  6e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.31 
 
 
469 aa  310  3e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2538  chromate transporter  44.35 
 
 
465 aa  307  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2804  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.68 
 
 
470 aa  306  4e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1532  chromate transporter  42.92 
 
 
452 aa  304  2e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  45.81 
 
 
463 aa  304  3e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  48.71 
 
 
468 aa  303  5e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  46.19 
 
 
450 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  45.41 
 
 
454 aa  289  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  45.41 
 
 
454 aa  289  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  40.99 
 
 
443 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  41.87 
 
 
432 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  46.77 
 
 
431 aa  263  5e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  41.06 
 
 
449 aa  259  6e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  43.47 
 
 
418 aa  256  5e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  40.05 
 
 
428 aa  249  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  39.16 
 
 
417 aa  237  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  34 
 
 
428 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  1.19825e-05 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  34.72 
 
 
388 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.8 
 
 
472 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  30.21 
 
 
389 aa  167  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  30.39 
 
 
394 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  31.68 
 
 
383 aa  165  2e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  30.15 
 
 
393 aa  164  2e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  29.04 
 
 
392 aa  165  2e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  28.81 
 
 
392 aa  164  4e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  29.62 
 
 
397 aa  164  4e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  31.03 
 
 
396 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  31.03 
 
 
396 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  31.03 
 
 
396 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.16 
 
 
386 aa  160  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.35911e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.32 
 
 
391 aa  159  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.75 
 
 
382 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.31 
 
 
404 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  30.31 
 
 
398 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  29.71 
 
 
385 aa  156  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.84 
 
 
392 aa  156  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  28.57 
 
 
401 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  26 
 
 
420 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.82 
 
 
390 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.87 
 
 
390 aa  153  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  29.08 
 
 
401 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.5 
 
 
395 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.4 
 
 
393 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  27.59 
 
 
401 aa  149  1e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  29.27 
 
 
376 aa  148  2e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  28.87 
 
 
390 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  29.23 
 
 
399 aa  146  8e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  29.38 
 
 
376 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  27.53 
 
 
390 aa  141  2e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  27.53 
 
 
390 aa  141  2e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  29.95 
 
 
382 aa  140  5e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  25.33 
 
 
416 aa  140  5e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.49 
 
 
379 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  27.29 
 
 
390 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.64 
 
 
400 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.4 
 
 
472 aa  122  1e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>