224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0080 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
319 aa  653  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  33.97 
 
 
318 aa  156  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 
312 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  32.48 
 
 
312 aa  145  8e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  34.91 
 
 
323 aa  141  1e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  32.36 
 
 
337 aa  141  1e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  34.1 
 
 
319 aa  130  2e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  30.31 
 
 
315 aa  130  4e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  33.66 
 
 
364 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  33.11 
 
 
364 aa  129  7e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  36.33 
 
 
347 aa  129  8e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  31.14 
 
 
438 aa  127  4e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
315 aa  125  8e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 
321 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 
305 aa  120  4e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 
332 aa  118  1e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  34.81 
 
 
327 aa  118  1e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  32.42 
 
 
352 aa  118  2e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  31.65 
 
 
318 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 
330 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 
321 aa  115  7e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  31.48 
 
 
315 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  31.44 
 
 
314 aa  112  1e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  32.84 
 
 
349 aa  111  2e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  25.26 
 
 
367 aa  110  2e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  3.60179e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 
316 aa  110  4e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  31.99 
 
 
310 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  30.45 
 
 
312 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  27.87 
 
 
309 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.26 
 
 
308 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  28.77 
 
 
287 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  26.55 
 
 
382 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
302 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  25.6 
 
 
378 aa  102  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  33.1 
 
 
346 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  28.33 
 
 
298 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.1498e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 
310 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 
299 aa  99.4  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 
321 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  30.47 
 
 
329 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  26.42 
 
 
337 aa  96.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 
310 aa  96.3  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 
351 aa  95.9  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  29.34 
 
 
319 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.73109e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  28.78 
 
 
318 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 
319 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 
320 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 
318 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 
332 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 
319 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  2.19811e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  28.03 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  31.11 
 
 
342 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  26.48 
 
 
308 aa  90.5  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  28.03 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  28.42 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 
342 aa  89.4  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  29 
 
 
334 aa  89  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  26.33 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  28.15 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  28.15 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 
339 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 
271 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  27.9 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  26.3 
 
 
323 aa  84.7  2e-15  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  27.69 
 
 
319 aa  84.3  3e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 
312 aa  83.6  4e-15  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  30.81 
 
 
264 aa  83.6  5e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  27.75 
 
 
323 aa  82.8  7e-15  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  25.46 
 
 
319 aa  82.4  8e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  25.18 
 
 
315 aa  80.5  3e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 
319 aa  80.1  4e-14  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
271 aa  80.1  4e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 
319 aa  80.1  4e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  29.35 
 
 
309 aa  78.6  1e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  24.49 
 
 
340 aa  78.2  2e-13  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  26.96 
 
 
318 aa  78.2  2e-13  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  24.84 
 
 
333 aa  77.4  3e-13  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
315 aa  77.4  3e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 
315 aa  76.6  5e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  26.96 
 
 
318 aa  76.3  6e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  24.91 
 
 
316 aa  76.3  6e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  26.96 
 
 
318 aa  76.3  6e-13  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  26.96 
 
 
318 aa  76.3  6e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  26.96 
 
 
318 aa  76.3  6e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  26.96 
 
 
318 aa  76.3  6e-13  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.96 
 
 
318 aa  76.3  6e-13  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 
315 aa  76.6  6e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  26.96 
 
 
318 aa  76.3  6e-13  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  26.23 
 
 
318 aa  76.3  6e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
313 aa  75.1  1e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 
304 aa  75.9  1e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 
321 aa  74.7  2e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2853  beta-lactamase domain-containing protein  23.64 
 
 
305 aa  74.3  2e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  3.07467e-05 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  23.95 
 
 
316 aa  73.9  3e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>