More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0065 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  90.84 
 
 
622 aa  1181  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  100 
 
 
632 aa  1323  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  88.26 
 
 
622 aa  1152  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.27 
 
 
635 aa  625  1e-178  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  3.19347e-09  hitchhiker  1.391e-07 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.21 
 
 
634 aa  565  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.96 
 
 
629 aa  566  1e-160  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.86 
 
 
627 aa  566  1e-160  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.2 
 
 
657 aa  560  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.7 
 
 
629 aa  554  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2129  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.7 
 
 
662 aa  550  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.27 
 
 
658 aa  545  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.16 
 
 
635 aa  545  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1837  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.27 
 
 
658 aa  545  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  3.90023e-06  normal  0.0111603 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.64 
 
 
625 aa  540  1e-152  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  4.83589e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1966  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.81 
 
 
667 aa  540  1e-152  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115626 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3198  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.83 
 
 
663 aa  536  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000352538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.15 
 
 
624 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.56 
 
 
659 aa  535  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.0424e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2893  adenylylsulfate reductase subunit alpha  43.94 
 
 
665 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.127343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1110  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.26 
 
 
664 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  9.90495e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2136  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.56 
 
 
664 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.290576  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0872  adenylylsulfate reductase subunit alpha  43.43 
 
 
673 aa  527  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.24 
 
 
591 aa  347  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  36.26 
 
 
574 aa  342  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.28 
 
 
594 aa  339  8e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.85 
 
 
590 aa  328  2e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.07 
 
 
579 aa  311  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.82 
 
 
566 aa  286  7e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.69 
 
 
563 aa  284  4e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  27.62 
 
 
576 aa  187  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  26.43 
 
 
574 aa  179  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  27.04 
 
 
569 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  26.43 
 
 
574 aa  179  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  26.54 
 
 
574 aa  177  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.83064e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  26.12 
 
 
579 aa  174  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  25.98 
 
 
579 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  25.64 
 
 
579 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  26.28 
 
 
574 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  25.96 
 
 
579 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  25.79 
 
 
579 aa  167  7e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  25.79 
 
 
579 aa  167  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  25.74 
 
 
579 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  25.73 
 
 
574 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  25.45 
 
 
591 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  24.84 
 
 
578 aa  153  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  25.89 
 
 
582 aa  152  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  24.96 
 
 
578 aa  149  2e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  25.57 
 
 
582 aa  147  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  25.53 
 
 
580 aa  147  7e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  26.34 
 
 
578 aa  146  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.12 
 
 
556 aa  137  6e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  25.25 
 
 
583 aa  130  7e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.44 
 
 
610 aa  127  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  24.36 
 
 
580 aa  123  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  25.2 
 
 
954 aa  121  4e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  22.82 
 
 
573 aa  109  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  23.72 
 
 
582 aa  80.1  1e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  22 
 
 
596 aa  79  3e-13  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.74 
 
 
579 aa  77.8  6e-13  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.24 
 
 
566 aa  76.3  1e-12  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.02 
 
 
577 aa  73.2  1e-11  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  23.21 
 
 
573 aa  72.8  2e-11  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.9 
 
 
583 aa  72.4  2e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.55 
 
 
566 aa  71.6  4e-11  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  6.05931e-05 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  29.23 
 
 
641 aa  69.7  2e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6464  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.51 
 
 
583 aa  68.9  2e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.723061  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  22.74 
 
 
570 aa  68.6  3e-10  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  22.34 
 
 
592 aa  68.9  3e-10  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2107  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.96 
 
 
603 aa  68.2  4e-10  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.87 
 
 
595 aa  67.4  7e-10  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.76 
 
 
600 aa  67.4  8e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.38 
 
 
596 aa  67.4  9e-10  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.79 
 
 
592 aa  66.6  1e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.7 
 
 
539 aa  66.6  1e-09  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  21.06 
 
 
587 aa  66.6  1e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1129  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.18 
 
 
599 aa  67  1e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.81 
 
 
584 aa  67  1e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892416  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  21.45 
 
 
596 aa  66.2  2e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.93 
 
 
589 aa  66.2  2e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.93 
 
 
589 aa  66.2  2e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1202  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.76 
 
 
599 aa  65.5  3e-09  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2111e-07 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  21.71 
 
 
592 aa  65.5  3e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.47 
 
 
594 aa  65.5  3e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0770  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.32 
 
 
593 aa  64.7  4e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0376  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.3 
 
 
597 aa  64.7  4e-09  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0965  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.2 
 
 
583 aa  64.7  5e-09  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.297334  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.32 
 
 
591 aa  64.7  5e-09  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.94 
 
 
563 aa  64.7  6e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  20.16 
 
 
597 aa  64.3  6e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  20.62 
 
 
584 aa  64.3  6e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.64 
 
 
611 aa  64.3  6e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25820  succinate dehydrogenase subunit A  21.86 
 
 
612 aa  64.3  7e-09  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.722118  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.96 
 
 
592 aa  63.9  8e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0887  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.07 
 
 
583 aa  63.9  8e-09  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0679  fumarate reductase flavoprotein subunit  19.91 
 
 
621 aa  63.5  1e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.918858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.89 
 
 
602 aa  63.2  1e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.34 
 
 
596 aa  63.2  1e-08  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41812  succinate dehydrogenase flavoprotein  22.5 
 
 
638 aa  63.5  1e-08  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.26 
 
 
587 aa  62.8  2e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.08 
 
 
570 aa  62.4  2e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>