24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0061 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0061  CBS domain containing protein  100 
 
 
201 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0342  CBS domain containing protein  65.17 
 
 
200 aa  240  9e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2957  CBS domain-containing protein  47.4 
 
 
196 aa  161  5e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0454  CBS  52.44 
 
 
218 aa  161  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2062  CBS domain protein  45.08 
 
 
197 aa  157  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.628455  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1720  putative signal-transduction protein with CBS domains  45.08 
 
 
197 aa  157  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.346801 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2064  hypothetical protein  44.44 
 
 
195 aa  150  9e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0577346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1893  CBS  41.5 
 
 
199 aa  148  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0664  hypothetical protein  44.97 
 
 
216 aa  138  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.358372  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0102  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 
209 aa  136  3e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.653521  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1857  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 
197 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0333  CBS domain-containing protein  29.9 
 
 
197 aa  99.8  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2035  hypothetical protein  33.16 
 
 
203 aa  85.1  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03825  CBS domain protein  32 
 
 
187 aa  81.3  9e-15  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2459  CBS domain-containing protein  31.74 
 
 
185 aa  79.7  2e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3704  signal transduction protein  31.07 
 
 
195 aa  79.7  3e-14  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  1.22502e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2693  CBS domain-containing protein  31.49 
 
 
215 aa  78.2  8e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1244  CBS domain-containing protein  26.45 
 
 
186 aa  67.4  1e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1349  CBS domain-containing protein  26.8 
 
 
186 aa  67  2e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.735809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1518  CBS domain-containing protein  27.33 
 
 
186 aa  64.7  9e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  3.00284e-05  hitchhiker  0.000492354 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3813  hypothetical protein  29.03 
 
 
187 aa  61.2  1e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00350231  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2237  CBS domain-containing protein  28.31 
 
 
197 aa  53.5  2e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.303434  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  38.6 
 
 
143 aa  45.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  27.71 
 
 
221 aa  42.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>