52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0060 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
178 aa  364  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0341  phosphodiesterase, MJ0936 family  79.53 
 
 
171 aa  267  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.431716  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  54.24 
 
 
183 aa  197  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  8.44745e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  39.51 
 
 
162 aa  91.7  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  40.62 
 
 
176 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  31.98 
 
 
168 aa  82  4e-15  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  30.97 
 
 
158 aa  77  1e-13  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  30.97 
 
 
158 aa  77  1e-13  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  34.46 
 
 
176 aa  76.3  2e-13  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  32.94 
 
 
173 aa  74.7  6e-13  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  28.31 
 
 
158 aa  74.3  8e-13  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  33.33 
 
 
175 aa  73.6  1e-12  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  31.51 
 
 
163 aa  72.8  2e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  29.45 
 
 
164 aa  72.4  3e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  31.46 
 
 
171 aa  71.6  5e-12  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  30.56 
 
 
173 aa  71.2  6e-12  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  31.46 
 
 
171 aa  70.5  1e-11  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  31.58 
 
 
168 aa  70.5  1e-11  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.64 
 
 
162 aa  70.1  2e-11  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  28.02 
 
 
171 aa  68.9  3e-11  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.01 
 
 
167 aa  67.8  7e-11  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.92 
 
 
163 aa  67  1e-10  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  30.41 
 
 
168 aa  67  1e-10  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  30.34 
 
 
171 aa  66.2  2e-10  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  26.54 
 
 
180 aa  65.9  3e-10  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  26.51 
 
 
158 aa  65.5  3e-10  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  34.12 
 
 
166 aa  65.1  6e-10  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.18 
 
 
167 aa  63.2  2e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  27.71 
 
 
166 aa  62.4  4e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.06 
 
 
166 aa  60.1  2e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.08 
 
 
169 aa  55.5  4e-07  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  28.99 
 
 
165 aa  53.5  2e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  30.77 
 
 
151 aa  52  4e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.03 
 
 
184 aa  52  5e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  25 
 
 
174 aa  52  5e-06  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  32.64 
 
 
152 aa  48.5  5e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  30.46 
 
 
174 aa  47.8  9e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  30.28 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.86 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  7.39352e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.59 
 
 
172 aa  45.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  30.56 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.26 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.45 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  30.56 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  30.34 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.32589e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  22.81 
 
 
158 aa  42  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3372  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.66 
 
 
234 aa  42.4  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.46 
 
 
170 aa  42  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  27.92 
 
 
148 aa  41.6  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.43 
 
 
156 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  5.90014e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.74 
 
 
157 aa  41.2  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  28.57 
 
 
177 aa  40.8  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>