More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0059 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  70.5 
 
 		 978 aa  1411    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  70.63 
 
 		 978 aa  1426    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  53.91 
 
 		 958 aa  1035    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  68.85 
 
 		 981 aa  1347    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  70.63 
 
 		 978 aa  1427    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  69.94 
 
 		 978 aa  1406    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  52.31 
 
 		 935 aa  956    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  83.7 
 
 		 969 aa  1709    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  55.21 
 
 		 968 aa  1042    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  100 
 
 		 953 aa  1986    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  50.27 
 
 		 932 aa  915    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  71.03 
 
 		 974 aa  1434    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  55.13 
 
 		 974 aa  1040    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  49.56 
 
 		 928 aa  885    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  69.48 
 
 		 978 aa  1415    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  65.59 
 
 		 961 aa  1297    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  70.29 
 
 		 974 aa  1421    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  70.53 
 
 		 973 aa  1424    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  65.62 
 
 		 979 aa  1297    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  54.81 
 
 		 973 aa  1005    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  68.37 
 
 		 981 aa  1343    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  70.63 
 
 		 973 aa  1425    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  70.48 
 
 		 973 aa  1427    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  70.63 
 
 		 973 aa  1426    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  70.63 
 
 		 973 aa  1425    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  47.85 
 
 		 923 aa  834    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  28.51 
 
 		 833 aa  221  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  28.96 
 
 		 817 aa  200  9e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  25.29 
 
 		 858 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  24.53 
 
 		 781 aa  197  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  24.87 
 
 		 837 aa  196  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  27.7 
 
 		 812 aa  193  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  23.23 
 
 		 934 aa  187  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  28.38 
 
 		 856 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  25.81 
 
 		 910 aa  180  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  25.22 
 
 		 917 aa  174  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.444202 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0612  conserved hypothetical protein  31.91 
 
 		 1426 aa  171  6e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  25.44 
 
 		 722 aa  170  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  25.75 
 
 		 928 aa  169  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  24.88 
 
 		 909 aa  169  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  23.49 
 
 		 1155 aa  167  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0814  anaerobic dehydrogenase  34.22 
 
 		 1434 aa  167  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0197792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.39 
 
 		 864 aa  166  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  23.45 
 
 		 826 aa  165  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  25.95 
 
 		 932 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  21.76 
 
 		 992 aa  164  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  25.64 
 
 		 930 aa  164  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  24.29 
 
 		 911 aa  163  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  26.23 
 
 		 803 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  25.87 
 
 		 803 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  24.19 
 
 		 807 aa  162  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  24.21 
 
 		 856 aa  161  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  27.8 
 
 		 805 aa  160  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  23.36 
 
 		 839 aa  159  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  24.15 
 
 		 1029 aa  159  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16890  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.1 
 
 		 1018 aa  159  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  23.36 
 
 		 1031 aa  158  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  25.12 
 
 		 765 aa  157  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  27.8 
 
 		 805 aa  157  8e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  25.76 
 
 		 730 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  25.53 
 
 		 800 aa  155  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  22.45 
 
 		 855 aa  155  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  25.62 
 
 		 947 aa  154  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  23.83 
 
 		 1148 aa  152  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.38 
 
 		 1020 aa  151  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.38 
 
 		 1020 aa  151  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  23.49 
 
 		 843 aa  150  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  22.53 
 
 		 927 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2959  molybdopterin oxidoreductase  24.89 
 
 		 913 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791344  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.17 
 
 		 826 aa  149  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1418  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.63 
 
 		 814 aa  149  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2089  orotate phosphoribosyltransferase (oprt; oprtase)  22.21 
 
 		 996 aa  147  6e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0216873  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  23.43 
 
 		 938 aa  147  8.000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.07 
 
 		 836 aa  146  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  23.36 
 
 		 820 aa  145  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  25.04 
 
 		 733 aa  145  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27 
 
 		 942 aa  144  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  32.22 
 
 		 800 aa  144  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0325829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  24.46 
 
 		 814 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.46 
 
 		 814 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.46 
 
 		 814 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.91 
 
 		 814 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.46 
 
 		 814 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.91 
 
 		 814 aa  144  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  24.46 
 
 		 814 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.46 
 
 		 814 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.08 
 
 		 814 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003032  tetrathionate reductase subunit A  24.09 
 
 		 1030 aa  143  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  35.83 
 
 		 759 aa  142  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.35 
 
 		 814 aa  142  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  27.59 
 
 		 784 aa  142  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0422  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.13 
 
 		 806 aa  142  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0580651  decreased coverage  0.000000000595111 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  22.88 
 
 		 1002 aa  142  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.3924 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.35 
 
 		 814 aa  142  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.91 
 
 		 814 aa  142  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  24.58 
 
 		 851 aa  140  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.97 
 
 		 814 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2177  sulfur reductase, molybdopterin subunit  24.43 
 
 		 909 aa  138  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1835  molybdopterin oxidoreductase  24.43 
 
 		 916 aa  138  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.357483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  21.47 
 
 		 866 aa  137  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>