33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0057 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0057  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  100 
 
 
327 aa  643  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0338  hypothetical protein  68.5 
 
 
327 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1741  hypothetical protein  53.05 
 
 
316 aa  327  1e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665621  normal  0.278657 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4942  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  52.44 
 
 
316 aa  321  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1999  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  54.41 
 
 
317 aa  315  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4522  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  54.71 
 
 
315 aa  299  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.758783  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6212  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  50.61 
 
 
317 aa  292  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2340  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  49.85 
 
 
316 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3108  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  49.85 
 
 
316 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1358  hypothetical protein  49.85 
 
 
316 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2049  hypothetical protein  49.85 
 
 
316 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1074  hypothetical protein  49.85 
 
 
316 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1447  DMSO reductase chain C  49.85 
 
 
316 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3223  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  50.15 
 
 
316 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3813  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  48.17 
 
 
310 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0858  hypothetical protein  48.78 
 
 
310 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1799  DMSO reductase anchor subunit  42.51 
 
 
324 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00050464  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3994  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  44.68 
 
 
310 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195622  normal  0.0360257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0572  DMSO reductase chain C  34.86 
 
 
312 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  3.2468e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0146  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.46 
 
 
349 aa  128  1e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.345045 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1441  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  35.65 
 
 
291 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1677  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.39 
 
 
315 aa  112  1e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0495248  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1236  DMSO reductase anchor subunit  32.11 
 
 
295 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.66345  normal  0.0462913 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1934  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.73 
 
 
312 aa  99  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2644  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  42.51 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.022311  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0769  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  29.72 
 
 
295 aa  54.3  3e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1739  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.64 
 
 
551 aa  53.9  4e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2344  putative anaerobic reductase component  31.06 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.755425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1278  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  44.23 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.394245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2336  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  50 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1281  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  44.44 
 
 
280 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.70499e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2924  putative anaerobic DMSO reductase chain C anchor subunit  31.93 
 
 
289 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00138794  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2335  hypothetical protein  44.44 
 
 
292 aa  42.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>