More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0054 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  81 
 
 
404 aa  686  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  86.25 
 
 
403 aa  735  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  100 
 
 
402 aa  826  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  80 
 
 
404 aa  671  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  80.25 
 
 
404 aa  680  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  80.65 
 
 
406 aa  680  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  66.83 
 
 
405 aa  555  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  47.45 
 
 
388 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  40 
 
 
415 aa  263  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  3.66711e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  37.28 
 
 
407 aa  251  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  37.65 
 
 
418 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  39.5 
 
 
404 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  41.4 
 
 
415 aa  247  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  39.52 
 
 
415 aa  247  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.55584e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  37.26 
 
 
414 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  37.02 
 
 
414 aa  246  7e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  38.3 
 
 
414 aa  242  1e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  38.31 
 
 
419 aa  239  6e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  36.9 
 
 
420 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  36.9 
 
 
420 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  40.05 
 
 
408 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.05708e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  39.07 
 
 
414 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  39.69 
 
 
409 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  35.79 
 
 
403 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  37.28 
 
 
421 aa  221  1e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  37.94 
 
 
418 aa  222  1e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  36.71 
 
 
420 aa  219  7e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  37.19 
 
 
418 aa  219  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  37.65 
 
 
419 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  35.46 
 
 
421 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  35.14 
 
 
400 aa  217  3e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  34.88 
 
 
400 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  34.94 
 
 
419 aa  214  2e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  39.18 
 
 
394 aa  214  2e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  35.73 
 
 
420 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  34.94 
 
 
420 aa  210  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  34.75 
 
 
427 aa  209  9e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  34.52 
 
 
417 aa  207  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  35.42 
 
 
418 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  37.38 
 
 
422 aa  204  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  35.41 
 
 
421 aa  191  3e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  33.73 
 
 
447 aa  189  6e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  35.19 
 
 
404 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  36.28 
 
 
419 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  36.36 
 
 
417 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  33.99 
 
 
429 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  31.37 
 
 
424 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  29.53 
 
 
460 aa  177  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  35.26 
 
 
418 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  32.77 
 
 
378 aa  166  7e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  30.23 
 
 
402 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  36.48 
 
 
422 aa  160  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  33.69 
 
 
406 aa  159  8e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  28.77 
 
 
343 aa  97.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.15 
 
 
346 aa  93.6  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  6.10364e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 
341 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  29.35 
 
 
341 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.3 
 
 
429 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  29.1 
 
 
342 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.53 
 
 
444 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  30.38 
 
 
440 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0531  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.4 
 
 
437 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  30.74 
 
 
346 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  27.99 
 
 
342 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.7 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  27.58 
 
 
342 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.21 
 
 
444 aa  87.8  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.08 
 
 
439 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.07 
 
 
418 aa  87  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.94 
 
 
445 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.06 
 
 
461 aa  85.9  1e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.72 
 
 
429 aa  85.1  2e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  25.14 
 
 
341 aa  85.5  2e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.52 
 
 
445 aa  85.1  2e-15  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.67 
 
 
450 aa  84.3  3e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  24.59 
 
 
343 aa  84.3  4e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  27.76 
 
 
348 aa  83.2  7e-15  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  27.3 
 
 
342 aa  82.4  1e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  23.4 
 
 
340 aa  82.4  1e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  25.56 
 
 
342 aa  82.8  1e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  27.09 
 
 
339 aa  81.6  2e-14  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  26.53 
 
 
341 aa  82  2e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  29.66 
 
 
341 aa  80.9  3e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  27.11 
 
 
349 aa  81.3  3e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  27.65 
 
 
342 aa  80.9  3e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.75 
 
 
429 aa  80.9  4e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  25.17 
 
 
340 aa  80.9  4e-14  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0064  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.53 
 
 
438 aa  80.1  6e-14  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.88 
 
 
439 aa  80.1  7e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  28.57 
 
 
341 aa  80.1  7e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1743  6-phosphofructokinase  26.74 
 
 
416 aa  79.7  8e-14  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  29.95 
 
 
341 aa  79.7  8e-14  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  25.37 
 
 
341 aa  79.3  1e-13  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  26.67 
 
 
370 aa  79  1e-13  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  27.11 
 
 
360 aa  78.6  2e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  28.87 
 
 
341 aa  78.2  2e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  24.52 
 
 
341 aa  79  2e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  24.93 
 
 
341 aa  77.8  3e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37009  predicted protein  27.64 
 
 
433 aa  78.2  3e-13  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00175166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  25.61 
 
 
366 aa  77.4  4e-13  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>