56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0053 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0053  dienelactone hydrolase  100 
 
 
290 aa  595  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0666  dienelactone hydrolase  54.26 
 
 
284 aa  315  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2269  putative dienelactone hydrolase  37.89 
 
 
266 aa  152  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  23.51 
 
 
290 aa  58.2  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  26.17 
 
 
275 aa  56.2  6e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  22.81 
 
 
290 aa  55.5  1e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  26.77 
 
 
335 aa  53.9  3e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0914  dienelactone hydrolase  26.32 
 
 
255 aa  53.1  6e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  26.82 
 
 
261 aa  51.6  1e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.48 
 
 
755 aa  50.4  3e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  27.09 
 
 
296 aa  50.1  4e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  25.32 
 
 
356 aa  48.9  9e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  28.81 
 
 
232 aa  48.9  9e-05  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  23.2 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.53 
 
 
594 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  23.94 
 
 
326 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  25.51 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  28.41 
 
 
227 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  39.51 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  25 
 
 
302 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  25.5 
 
 
243 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  20.23 
 
 
251 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  25.5 
 
 
243 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2202  dienelactone hydrolase  25.11 
 
 
528 aa  45.8  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.413126  decreased coverage  0.0031404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.13 
 
 
924 aa  45.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  23.98 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  21.39 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  23.53 
 
 
634 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  23.98 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  29.29 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  1.9377e-08 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2191  alpha/beta fold family hydrolase  26.83 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  23.65 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.97 
 
 
642 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2478  hypothetical protein  26.83 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000532827  normal  0.854923 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.26 
 
 
685 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  23.58 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  26.24 
 
 
287 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4372  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.06 
 
 
357 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  5.26664e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  23.47 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  24.32 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  26.96 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  32.56 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  28.23 
 
 
382 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  23.11 
 
 
227 aa  43.5  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.08 
 
 
706 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  32.56 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  32.56 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  23.66 
 
 
214 aa  43.5  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.48 
 
 
653 aa  43.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.58 
 
 
644 aa  43.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  24.03 
 
 
287 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  35.06 
 
 
351 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  24.88 
 
 
407 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  23.59 
 
 
295 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>