56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0048 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  100 
 
 
217 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  42.31 
 
 
174 aa  124  8e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  31.31 
 
 
203 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  1.82094e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  31.4 
 
 
186 aa  84  2e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  31.4 
 
 
186 aa  84  2e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  34.88 
 
 
175 aa  83.2  3e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45870  hypothetical protein  36.2 
 
 
169 aa  81.3  1e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  29.31 
 
 
174 aa  73.2  3e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  33.75 
 
 
190 aa  71.6  8e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  31.52 
 
 
182 aa  71.6  8e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4141  hypothetical protein  32.5 
 
 
188 aa  70.1  2e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  33.12 
 
 
190 aa  68.2  9e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5856  hypothetical protein  28.57 
 
 
173 aa  67  2e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  26.63 
 
 
207 aa  63.9  2e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  26.67 
 
 
181 aa  61.2  1e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  21.88 
 
 
178 aa  61.6  1e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.17224e-07 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  30.82 
 
 
174 aa  61.2  1e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  23.08 
 
 
181 aa  60.8  1e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67640  hypothetical protein  26.71 
 
 
173 aa  60.8  1e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  28.86 
 
 
184 aa  60.5  2e-08  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  25.42 
 
 
183 aa  60.8  2e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0356  hypothetical protein  27.33 
 
 
180 aa  58.9  6e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4819  hypothetical protein  29.09 
 
 
193 aa  57.8  1e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  30.22 
 
 
199 aa  57.8  1e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  27.22 
 
 
210 aa  57.4  2e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  56.82 
 
 
140 aa  55.1  8e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  25.31 
 
 
206 aa  54.3  1e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  27.5 
 
 
168 aa  54.7  1e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  53.5  3e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  25.48 
 
 
210 aa  52.8  4e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  50 
 
 
140 aa  52  6e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  24.86 
 
 
172 aa  52  6e-06  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  26.88 
 
 
168 aa  52  6e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  25.25 
 
 
178 aa  52  7e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  26.88 
 
 
168 aa  51.6  8e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  26.88 
 
 
168 aa  51.6  8e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  26.38 
 
 
179 aa  51.2  1e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  27.78 
 
 
203 aa  51.6  1e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  48 
 
 
140 aa  49.7  4e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  25.32 
 
 
177 aa  48.9  5e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  44.19 
 
 
156 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0342  hypothetical protein  26.29 
 
 
169 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  22.03 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0181  hypothetical protein  34.67 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0488786  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  24.68 
 
 
177 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  1.27449e-06 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  44.23 
 
 
145 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  44.9 
 
 
163 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  22.96 
 
 
196 aa  45.4  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  36.96 
 
 
147 aa  45.1  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0696  hypothetical protein  45.65 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  24.16 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  24.83 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3706  hypothetical protein  51.52 
 
 
149 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  41.3 
 
 
140 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1026  hypothetical protein  23.9 
 
 
184 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  24.83 
 
 
177 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>