29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0046 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0046  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  261  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0085  hypothetical protein  50.68 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.551447  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0165  hypothetical protein  45.07 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0542  hypothetical protein  36.59 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0556  hypothetical protein  39.13 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.88275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2466  hypothetical protein  34.41 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.939512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3815  hypothetical protein  40.58 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349776  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2423  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.455047  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0566  hypothetical protein  39.13 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2451  hypothetical protein  47.17 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0389  hypothetical protein  38.71 
 
 		 97 aa  50.1  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0447  hypothetical protein  38.71 
 
 		 97 aa  50.1  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.145575  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2862  hypothetical protein  44 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3942  putative secreted protein  37.29 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0153  hypothetical protein  42.42 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0547  hypothetical protein  33.85 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.108831  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00640  hypothetical protein  36.76 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.860448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72500  hypothetical protein  36.23 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6295  hypothetical protein  36.23 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0122  hypothetical protein  36.92 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5106  hypothetical protein  37.88 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0137  hypothetical protein  36.92 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0139  hypothetical protein  36.92 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357331  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0345  hypothetical protein  38.46 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0271  hypothetical protein  38.46 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0360  hypothetical protein  33.82 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0868173 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2694  conserved hypothetical secreted protein  36.67 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.551286  hitchhiker  0.00000908277 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3096  hypothetical protein  36.67 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03933  hypothetical protein  33.9 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>