More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0045 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  492  1e-138  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  81.33 
 
 
241 aa  407  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  72.2 
 
 
241 aa  367  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  70.54 
 
 
241 aa  357  7e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2422  hypothetical protein  70.54 
 
 
241 aa  330  9e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113296  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  68.92 
 
 
239 aa  328  7e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  68.66 
 
 
243 aa  321  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  65.64 
 
 
242 aa  318  4e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  63.91 
 
 
245 aa  318  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  63.91 
 
 
239 aa  317  9e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  4.60605e-05 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  67.27 
 
 
242 aa  317  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  65.11 
 
 
242 aa  316  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  67.27 
 
 
241 aa  316  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  57.5 
 
 
252 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  57.74 
 
 
252 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  57.74 
 
 
252 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  57.74 
 
 
252 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  57.81 
 
 
247 aa  288  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  59.65 
 
 
252 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  55.1 
 
 
247 aa  286  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  55.78 
 
 
249 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  58.52 
 
 
252 aa  285  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  58.52 
 
 
252 aa  285  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  55.38 
 
 
249 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  55.38 
 
 
249 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  56.2 
 
 
244 aa  283  1e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  56.2 
 
 
244 aa  283  1e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  56.2 
 
 
244 aa  283  1e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  56.2 
 
 
244 aa  283  1e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  56.2 
 
 
244 aa  283  1e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  57.81 
 
 
239 aa  283  2e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  57.38 
 
 
239 aa  281  8e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  59.03 
 
 
317 aa  280  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  58.59 
 
 
317 aa  278  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  58.15 
 
 
317 aa  278  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  58.26 
 
 
218 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  1.13726e-06 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  55.86 
 
 
273 aa  256  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  55.72 
 
 
243 aa  244  1e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  2.55019e-08 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  54.46 
 
 
244 aa  241  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  55.61 
 
 
266 aa  239  3e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  51.18 
 
 
263 aa  238  7e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  49.57 
 
 
242 aa  238  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  51.33 
 
 
229 aa  236  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  52.36 
 
 
283 aa  236  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  51.33 
 
 
263 aa  235  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  55.33 
 
 
269 aa  233  2e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  55.84 
 
 
216 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.81982e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  53.77 
 
 
247 aa  233  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  51.87 
 
 
229 aa  233  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  52.83 
 
 
280 aa  231  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  50.73 
 
 
225 aa  231  6e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  54 
 
 
266 aa  231  8e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  53 
 
 
249 aa  231  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  1.09192e-06 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  52.83 
 
 
235 aa  229  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  49.33 
 
 
263 aa  228  8e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  48.4 
 
 
267 aa  227  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  53.17 
 
 
270 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  48 
 
 
247 aa  226  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1780  hypothetical protein  51.46 
 
 
218 aa  224  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00264225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  52.22 
 
 
217 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  54.23 
 
 
266 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  50.74 
 
 
260 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  49.76 
 
 
261 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  49.54 
 
 
267 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  53.03 
 
 
275 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1602  hypothetical protein  51.46 
 
 
218 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  50.23 
 
 
264 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  48.1 
 
 
220 aa  222  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.24566e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  51.74 
 
 
283 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  53.47 
 
 
278 aa  222  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  51.96 
 
 
279 aa  221  1e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0170  hypothetical protein  50.49 
 
 
218 aa  220  2e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2520  hypothetical protein  51.52 
 
 
260 aa  219  4e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  51.76 
 
 
258 aa  218  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  51.78 
 
 
259 aa  218  9e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  51.78 
 
 
261 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  50.75 
 
 
248 aa  217  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  51.72 
 
 
262 aa  216  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  49.75 
 
 
255 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  51.2 
 
 
267 aa  216  3e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  50.49 
 
 
268 aa  215  5e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  49.75 
 
 
266 aa  214  1e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  55.93 
 
 
241 aa  214  1e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  47.93 
 
 
245 aa  214  1e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  48.57 
 
 
332 aa  213  2e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  50.52 
 
 
243 aa  211  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  48.53 
 
 
245 aa  211  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2032  hypothetical protein  49.51 
 
 
222 aa  211  8e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  47.53 
 
 
240 aa  210  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  49.51 
 
 
245 aa  209  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  49.5 
 
 
289 aa  209  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  55 
 
 
288 aa  209  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  49.02 
 
 
245 aa  209  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  44.69 
 
 
245 aa  209  4e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  50.25 
 
 
275 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  48.45 
 
 
266 aa  206  3e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0405  hypothetical protein  51.67 
 
 
228 aa  204  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  48.1 
 
 
244 aa  203  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  1.50026e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  46.63 
 
 
313 aa  202  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  47.47 
 
 
259 aa  197  1e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>