32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0043 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0043  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  335  1e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.761972  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1816  hypothetical protein  40.98 
 
 
172 aa  88.2  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103062  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1576  hypothetical protein  36.29 
 
 
156 aa  87  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.678852  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1812  hypothetical protein  32.86 
 
 
142 aa  66.6  1e-10  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.639784  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1577  hypothetical protein  33.03 
 
 
130 aa  60.5  1e-08  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1922  hypothetical protein  29.36 
 
 
164 aa  57.8  7e-08  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0369  hypothetical protein  24.12 
 
 
158 aa  56.2  2e-07  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0924  hypothetical protein  28.21 
 
 
155 aa  55.1  4e-07  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  1.55714e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0904  hypothetical protein  21.05 
 
 
150 aa  55.5  4e-07  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  1.94814e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0918  hypothetical protein  20.39 
 
 
150 aa  55.1  5e-07  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  4.61903e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0988  hypothetical protein  20.39 
 
 
150 aa  53.5  1e-06  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0541  hypothetical protein  31.65 
 
 
163 aa  53.5  1e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1390  hypothetical protein  24.54 
 
 
158 aa  52  3e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1223  hypothetical protein  34.34 
 
 
283 aa  52  4e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.808212 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2213  hypothetical protein  24.17 
 
 
165 aa  50.8  8e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.17467e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0871  hypothetical protein  25 
 
 
154 aa  50.1  1e-05  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1271  hypothetical protein  39.06 
 
 
158 aa  49.3  2e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3249  hypothetical protein  39.06 
 
 
158 aa  49.3  2e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00452739  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2210  hypothetical protein  30.43 
 
 
141 aa  48.9  3e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120945  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0095  hypothetical protein  42.55 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.00941e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1790  hypothetical protein  22.22 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0036932  normal  0.183021 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0795  membrane protein  27.82 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04843  hypothetical protein  42.55 
 
 
141 aa  45.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1337  FixH family protein  29.73 
 
 
266 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0035  putative periplasmic protein  27.64 
 
 
137 aa  44.7  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1235  hypothetical protein  29.73 
 
 
266 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1368  hypothetical protein  26.24 
 
 
142 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.963563  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2106  hypothetical protein  26.15 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121868  normal  0.452338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3142  hypothetical protein  27.05 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00589306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1175  hypothetical protein  29.73 
 
 
265 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1984  hypothetical protein  26.05 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.9351e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2426  hypothetical protein  24.35 
 
 
154 aa  40.8  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0117545  hitchhiker  6.88315e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>