274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0042 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



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Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
215 aa  439  1e-122  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  43.84 
 
 
200 aa  132  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  41.52 
 
 
207 aa  124  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  37.66 
 
 
210 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  33.93 
 
 
291 aa  115  4e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  32.04 
 
 
203 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0796  hypothetical protein  37.11 
 
 
188 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  33.01 
 
 
208 aa  110  1e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.02596e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  40.94 
 
 
197 aa  110  2e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  40.6 
 
 
185 aa  110  2e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.25528e-05  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  37.31 
 
 
204 aa  107  9e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001099  cytochrome oxidase biogenesis protein Sco1/SenC/PrrC putative copper metallochaperone  37.5 
 
 
204 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04842  hypothetical protein  38.3 
 
 
204 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  39.85 
 
 
213 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  38.59 
 
 
206 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  39.44 
 
 
206 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 
210 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0096  SCO1/SenC family protein  35.82 
 
 
193 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.73101e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  38.61 
 
 
198 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  37.41 
 
 
192 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  38.26 
 
 
197 aa  101  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  39.38 
 
 
198 aa  101  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  36.69 
 
 
197 aa  98.6  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 
187 aa  98.2  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 
203 aa  98.2  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 
191 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.3207e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  36.22 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  32.08 
 
 
207 aa  95.1  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  32.88 
 
 
224 aa  95.5  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  41.53 
 
 
211 aa  95.1  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  33.15 
 
 
213 aa  95.1  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  35.29 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  40.34 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  33.1 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  36.75 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0870  SCO1/SenC family protein  30.73 
 
 
180 aa  92.4  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  29.53 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  34.67 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 
195 aa  92  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
200 aa  92  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
200 aa  92  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 
203 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  29.8 
 
 
287 aa  91.7  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  37.74 
 
 
193 aa  91.7  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 
206 aa  91.7  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  36.09 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  34.25 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  37.31 
 
 
218 aa  90.1  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1138  conserved hypothetical protein, probable SCO1/SenC family protein  38.1 
 
 
185 aa  89.7  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  32.31 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  35.54 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  32.45 
 
 
214 aa  89  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  35.42 
 
 
206 aa  89  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  37.27 
 
 
211 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  37.27 
 
 
211 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  31.36 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  30.48 
 
 
286 aa  87.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  29.82 
 
 
297 aa  87.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  32.52 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  32.4 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  32.4 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  32.4 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  32.4 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  32.4 
 
 
205 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  33.86 
 
 
212 aa  86.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  31.89 
 
 
219 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
201 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0379  electron transport protein SCO1/SenC  30.61 
 
 
190 aa  86.3  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  31.89 
 
 
219 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  31.89 
 
 
219 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  28.74 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  31.49 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  29.89 
 
 
210 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  29.89 
 
 
210 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 
211 aa  85.1  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  32.61 
 
 
197 aa  84.3  1e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  29.59 
 
 
205 aa  83.6  2e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  32.68 
 
 
205 aa  83.6  2e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  29.52 
 
 
205 aa  84  2e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  35.82 
 
 
310 aa  83.6  2e-15  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 
221 aa  83.6  2e-15  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  38.53 
 
 
210 aa  84  2e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 
210 aa  83.6  2e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  41.23 
 
 
215 aa  83.6  2e-15  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 
215 aa  84  2e-15  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  29.59 
 
 
205 aa  83.6  2e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  32.17 
 
 
201 aa  84  2e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  35.38 
 
 
231 aa  83.2  3e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  30.34 
 
 
205 aa  82.8  3e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  32.23 
 
 
204 aa  82.8  3e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  31.64 
 
 
210 aa  82.8  3e-15  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  32.08 
 
 
199 aa  83.2  3e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.160668 
 
 
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NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  35.17 
 
 
220 aa  83.2  3e-15  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
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