124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0039 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  100 
 
 
678 aa  1390  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  53.76 
 
 
679 aa  690  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0048  ResB-like  39.42 
 
 
664 aa  503  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.46708e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  41.53 
 
 
701 aa  496  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  38.66 
 
 
670 aa  471  1e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  36.98 
 
 
700 aa  468  1e-130  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  39.24 
 
 
660 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  33.71 
 
 
737 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  33.71 
 
 
737 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  33.71 
 
 
737 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  33.52 
 
 
740 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  33.95 
 
 
738 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  33.82 
 
 
719 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  34.76 
 
 
734 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  33.52 
 
 
738 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  33.72 
 
 
741 aa  406  1e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  34.51 
 
 
734 aa  408  1e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  32.95 
 
 
725 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  33.1 
 
 
740 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  33.09 
 
 
718 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  32.95 
 
 
725 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  32.81 
 
 
737 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  8.85403e-08 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  33.09 
 
 
718 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  33.09 
 
 
718 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  33.09 
 
 
718 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  33.38 
 
 
738 aa  405  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2986  putative cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  33.78 
 
 
700 aa  401  1e-110  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  33.62 
 
 
750 aa  399  1e-110  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  35.54 
 
 
724 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  33.14 
 
 
733 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0985  ResB family protein  34.5 
 
 
732 aa  395  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  34.24 
 
 
727 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  33.92 
 
 
679 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  33.76 
 
 
717 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  33.47 
 
 
717 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  34.26 
 
 
694 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0773  ResB-like  32.28 
 
 
739 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  31 
 
 
742 aa  364  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1132  ResB family protein  33.14 
 
 
722 aa  357  4e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3112  cytochrome c-type biogenesis protein ResB  31.92 
 
 
614 aa  319  8e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2710  ResB family protein  31.92 
 
 
614 aa  319  8e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000254674  unclonable  5.88279e-11 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  27.01 
 
 
458 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  24.69 
 
 
535 aa  103  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  25.39 
 
 
457 aa  99  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  26.4 
 
 
452 aa  94.7  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.44779e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  24.13 
 
 
454 aa  92  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.92342e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  26.97 
 
 
426 aa  90.9  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  27.01 
 
 
457 aa  89.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  25.67 
 
 
452 aa  90.1  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.2859e-12  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  25.14 
 
 
423 aa  88.2  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  26.9 
 
 
511 aa  87.8  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.22 
 
 
429 aa  87  1e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  25.25 
 
 
454 aa  85.5  3e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  24.28 
 
 
453 aa  83.6  1e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.82388e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  26.65 
 
 
428 aa  83.2  2e-14  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  25.41 
 
 
452 aa  80.1  1e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  25.57 
 
 
434 aa  79.7  2e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.81016e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  25.75 
 
 
461 aa  79.3  2e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  25.75 
 
 
461 aa  79.3  2e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.84 
 
 
428 aa  79.7  2e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.85 
 
 
428 aa  78.6  3e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  23.4 
 
 
554 aa  77.8  7e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.22 
 
 
428 aa  76.6  1e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  26.91 
 
 
426 aa  77  1e-12  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  24.53 
 
 
457 aa  75.5  3e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  24.53 
 
 
455 aa  72.8  2e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  21.66 
 
 
553 aa  72  4e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  24 
 
 
461 aa  71.2  5e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04711  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.88 
 
 
432 aa  70.5  1e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  22.52 
 
 
542 aa  70.1  1e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  23.28 
 
 
472 aa  68.6  3e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  25.46 
 
 
395 aa  67.4  8e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  22.81 
 
 
456 aa  67  1e-09  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  27.07 
 
 
426 aa  65.9  3e-09  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2204  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.87 
 
 
432 aa  65.1  4e-09  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  25 
 
 
459 aa  64.7  5e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  23.2 
 
 
461 aa  64.7  6e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  23.84 
 
 
458 aa  64.3  7e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  24.27 
 
 
448 aa  63.2  2e-08  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  22.41 
 
 
457 aa  62.4  3e-08  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  20.45 
 
 
541 aa  60.8  8e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0530  ResB family protein  22.04 
 
 
429 aa  60.1  1e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  19.81 
 
 
541 aa  60.5  1e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.91918e-14 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  22.78 
 
 
578 aa  59.7  2e-07  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1567  resB protein  20.12 
 
 
541 aa  58.9  3e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70106e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1495  resB protein  20.12 
 
 
541 aa  58.9  3e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1384  resB protein  20.12 
 
 
541 aa  58.9  3e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.615548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  19.48 
 
 
538 aa  58.5  4e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  21.5 
 
 
541 aa  58.5  4e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  20.92 
 
 
541 aa  58.2  5e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1357  cytochrome c biogenesis protein  22 
 
 
541 aa  57.8  6e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  21.67 
 
 
541 aa  57.4  8e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  21.88 
 
 
484 aa  57.4  8e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  24.07 
 
 
522 aa  57  1e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  24.76 
 
 
596 aa  56.2  2e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  31.79 
 
 
572 aa  54.7  5e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  25.76 
 
 
544 aa  55.1  5e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  21.93 
 
 
565 aa  54.3  8e-06  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  29.33 
 
 
782 aa  53.9  1e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  23.23 
 
 
539 aa  52.4  3e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>