More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0038 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  100 
 
 
390 aa  780  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  56.39 
 
 
454 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  56.25 
 
 
379 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  54.97 
 
 
381 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  55.08 
 
 
391 aa  423  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  56.2 
 
 
407 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  54.99 
 
 
401 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  56.17 
 
 
394 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  54.81 
 
 
395 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  53.69 
 
 
395 aa  405  1e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  54.29 
 
 
395 aa  405  1e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  55.26 
 
 
396 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  55.26 
 
 
396 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  55.26 
 
 
396 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  55.26 
 
 
408 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  55.64 
 
 
396 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  55.26 
 
 
396 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  55.81 
 
 
395 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  55.26 
 
 
396 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  55.26 
 
 
396 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  54.07 
 
 
396 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  52.96 
 
 
403 aa  401  1e-110  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  53.87 
 
 
396 aa  399  1e-110  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  53.85 
 
 
396 aa  399  1e-110  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  53.85 
 
 
396 aa  399  1e-110  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  52.58 
 
 
405 aa  400  1e-110  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  53.68 
 
 
396 aa  400  1e-110  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  53.68 
 
 
401 aa  399  1e-110  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  4.022e-08 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  53.42 
 
 
396 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1133  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  50.94 
 
 
438 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  53.42 
 
 
396 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5587  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  49.77 
 
 
446 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405546  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0666  cytochrome c assembly protein  49.43 
 
 
463 aa  391  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  49.17 
 
 
444 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  47.87 
 
 
465 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  49.17 
 
 
444 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  50.12 
 
 
405 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  50 
 
 
444 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  49.17 
 
 
442 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0434  putative cytochrome c asssembly protein  46.09 
 
 
473 aa  360  3e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.105274  normal  0.205387 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.48 
 
 
395 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  3.73166e-11 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  48.3 
 
 
352 aa  328  8e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  44.92 
 
 
284 aa  206  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.58 
 
 
283 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.01 
 
 
282 aa  202  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  42.86 
 
 
284 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.7273e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  40.91 
 
 
282 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  3.53743e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  41.03 
 
 
284 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.76179e-07  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  40.14 
 
 
283 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  42.18 
 
 
276 aa  190  3e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.34 
 
 
282 aa  190  3e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  39.19 
 
 
271 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.60033e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  37.63 
 
 
278 aa  188  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  41.77 
 
 
271 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  39.35 
 
 
271 aa  185  1e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.93 
 
 
282 aa  184  2e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  43.24 
 
 
271 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  40.54 
 
 
285 aa  183  5e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.79 
 
 
271 aa  182  8e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.41 
 
 
271 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.38241e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  39.66 
 
 
283 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.17 
 
 
310 aa  180  3e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  1.43982e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.48 
 
 
284 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.43711e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.91 
 
 
283 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  40.27 
 
 
278 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.53378e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.7 
 
 
272 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.94 
 
 
323 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  38.5 
 
 
283 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  36.67 
 
 
304 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  35.77 
 
 
325 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  34.96 
 
 
329 aa  154  3e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  39.39 
 
 
397 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  41.26 
 
 
255 aa  152  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.19 
 
 
346 aa  152  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.44 
 
 
330 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.18 
 
 
309 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  37.66 
 
 
396 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  38.53 
 
 
320 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  37.08 
 
 
304 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.97 
 
 
341 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.97 
 
 
341 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.12 
 
 
349 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  39.11 
 
 
378 aa  144  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  33.33 
 
 
315 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.37 
 
 
328 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  34.93 
 
 
279 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.08 
 
 
258 aa  142  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  35.25 
 
 
315 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.85 
 
 
373 aa  141  2e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  35.34 
 
 
327 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  34.84 
 
 
318 aa  137  3e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.28 
 
 
339 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  39.2 
 
 
325 aa  135  1e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  34.36 
 
 
324 aa  135  2e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.37 
 
 
301 aa  134  2e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  36.44 
 
 
330 aa  134  2e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  33.69 
 
 
309 aa  134  2e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  34.87 
 
 
309 aa  135  2e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.33 
 
 
321 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8079  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.75 
 
 
358 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0986266  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>