80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0035 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 290 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.74 
 
 		 294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.38 
 
 		 271 aa  255  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.635423  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.58 
 
 		 277 aa  243  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  50.6 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0159  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.39 
 
 		 290 aa  238  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.171713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.63 
 
 		 276 aa  237  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3567  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.94 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202667  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.36 
 
 		 288 aa  235  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0143  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.79 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.19 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0145  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.79 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0128  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.79 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0051  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.37 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  48.24 
 
 		 286 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  46.79 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6287  hypothetical protein  47.77 
 
 		 274 aa  224  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.43 
 
 		 282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2166  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.57 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  38.37 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04435  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.16 
 
 		 255 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.45 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0781  hypothetical protein  37.04 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.86 
 
 		 245 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.325788  normal  0.617389 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.17 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.71 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.88 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.24 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.94 
 
 		 837 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.97 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  27.19 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.41 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.8 
 
 		 808 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.57 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.35 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.58 
 
 		 245 aa  52.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.49 
 
 		 242 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.03 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.73 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.8 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.53 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.09 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.07 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.88 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1010  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.52 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  32.61 
 
 		 369 aa  49.7  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.1 
 
 		 240 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.7 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.29 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.85 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.86 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.96 
 
 		 644 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.39 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.8 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.93 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.56 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.85 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  31.69 
 
 		 316 aa  46.2  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.11 
 
 		 266 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.15 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.13 
 
 		 240 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  29.13 
 
 		 240 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.39 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0409  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.58 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596587  normal  0.0713633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  30.07 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  27.88 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  24.82 
 
 		 639 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.94 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.08 
 
 		 356 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.43 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.05 
 
 		 639 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.94 
 
 		 242 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.87 
 
 		 266 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 		 233 aa  42.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.11 
 
 		 260 aa  42.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>