More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0033 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  100 
 
 
294 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  51.55 
 
 
294 aa  242  6e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  38.19 
 
 
293 aa  192  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  5.2274e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  41 
 
 
305 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  41.36 
 
 
320 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  40.82 
 
 
311 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  39.04 
 
 
296 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  37.42 
 
 
303 aa  162  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  37.42 
 
 
303 aa  162  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  35.49 
 
 
308 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  35.31 
 
 
305 aa  119  5e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 
306 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  36.33 
 
 
300 aa  112  7e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  9.87488e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  27.62 
 
 
301 aa  112  8e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  30.96 
 
 
300 aa  112  8e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  29.14 
 
 
292 aa  110  2e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  32.65 
 
 
300 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  28.93 
 
 
296 aa  109  7e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  5.67214e-06 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.25 
 
 
298 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  29.68 
 
 
299 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  27.9 
 
 
303 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  30.95 
 
 
312 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  36.39 
 
 
320 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  32.62 
 
 
297 aa  95.9  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  26.13 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  30.23 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  31.8 
 
 
322 aa  85.9  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  30.74 
 
 
298 aa  85.9  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  30 
 
 
323 aa  83.6  3e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  31.31 
 
 
329 aa  83.6  4e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  30.38 
 
 
302 aa  82.4  8e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  27.97 
 
 
324 aa  82.4  8e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  26.62 
 
 
319 aa  78.6  1e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  26.62 
 
 
319 aa  78.6  1e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  29.94 
 
 
311 aa  78.6  1e-13  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  33.09 
 
 
313 aa  77.8  2e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  23.42 
 
 
311 aa  76.6  5e-13  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  32.97 
 
 
310 aa  76.3  6e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  30.27 
 
 
311 aa  75.9  7e-13  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  32.96 
 
 
319 aa  75.9  8e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  28.24 
 
 
311 aa  75.5  1e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  29.41 
 
 
337 aa  73.6  4e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  29.67 
 
 
319 aa  73.2  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  29.33 
 
 
319 aa  72.8  7e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  31.9 
 
 
310 aa  72.4  8e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  29.17 
 
 
304 aa  72.4  9e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  29.33 
 
 
319 aa  71.6  1e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  28.9 
 
 
307 aa  72  1e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  31.09 
 
 
312 aa  71.6  1e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 
319 aa  72  1e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  2.96005e-08 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  30.34 
 
 
319 aa  71.6  2e-11  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.95 
 
 
337 aa  71.6  2e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  29.2 
 
 
333 aa  70.9  2e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  29 
 
 
319 aa  70.9  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  28.12 
 
 
319 aa  70.9  3e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  29.17 
 
 
304 aa  70.5  3e-11  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  30.59 
 
 
321 aa  70.5  3e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  28.75 
 
 
325 aa  70.1  4e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  1.03669e-05  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  29.11 
 
 
315 aa  69.7  6e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  27.87 
 
 
323 aa  69.3  7e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  28.16 
 
 
323 aa  69.3  7e-11  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  28.12 
 
 
319 aa  69.3  7e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  29.2 
 
 
333 aa  69.3  8e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  32.59 
 
 
306 aa  68.9  9e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  30.48 
 
 
319 aa  68.9  1e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  27.24 
 
 
309 aa  68.6  1e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  32.47 
 
 
343 aa  68.6  1e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  28.78 
 
 
312 aa  68.6  1e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.54 
 
 
306 aa  68.2  1e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  29.52 
 
 
315 aa  68.2  1e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  26.32 
 
 
323 aa  67.8  2e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  26.89 
 
 
307 aa  67.4  2e-10  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  28.41 
 
 
308 aa  67.8  2e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  28.26 
 
 
319 aa  67.8  2e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  29 
 
 
319 aa  67.8  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  31.33 
 
 
306 aa  67.8  2e-10  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  26.15 
 
 
313 aa  67.4  3e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  25.18 
 
 
310 aa  67.4  3e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  26.15 
 
 
313 aa  67.4  3e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  28.26 
 
 
319 aa  67  3e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  28.26 
 
 
319 aa  67  3e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  26.15 
 
 
313 aa  67.4  3e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  26.22 
 
 
313 aa  67  4e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  27.03 
 
 
327 aa  66.6  4e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  28.1 
 
 
310 aa  66.6  5e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  33.87 
 
 
316 aa  65.1  1e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  25.26 
 
 
313 aa  65.5  1e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  25.81 
 
 
338 aa  64.7  2e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  26.98 
 
 
316 aa  64.3  2e-09  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  32.59 
 
 
332 aa  63.9  3e-09  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.53 
 
 
322 aa  63.9  3e-09  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  25.63 
 
 
314 aa  63.5  4e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  31.27 
 
 
308 aa  63.5  4e-09  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  28.2 
 
 
312 aa  63.2  5e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  26.88 
 
 
319 aa  63.2  5e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  29.55 
 
 
320 aa  63.2  6e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  30.34 
 
 
301 aa  62.8  7e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  27.87 
 
 
312 aa  62.8  7e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  31.13 
 
 
314 aa  62.8  7e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  24.08 
 
 
315 aa  62.4  8e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>