More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0031 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0031  aspartate/ornithine carbamoyltransferase carbamoyl-P binding domain protein  100 
 
 
360 aa  727  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.436716 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0184  aspartate/ornithine carbamoyltransferase carbamoyl-P binding domain protein  73.99 
 
 
362 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0778  aspartate/ornithine carbamoyltransferase  67.05 
 
 
360 aa  472  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.154324  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2634  aspartate carbamoyltransferase  61.22 
 
 
351 aa  428  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.614192  normal  0.659194 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2261  putative aspartate carbamoyltransferase  64.14 
 
 
380 aa  415  1e-115  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2668  aspartate carbamoyltransferase  33.97 
 
 
311 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1750  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  35.71 
 
 
302 aa  169  9e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.667028  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1681  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.86 
 
 
306 aa  167  4e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.947755  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2603  aspartate carbamoyltransferase  33.77 
 
 
359 aa  167  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1157  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  35.4 
 
 
315 aa  164  1e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1201  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  32.91 
 
 
307 aa  164  2e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0780  aspartate carbamoyltransferase  32.04 
 
 
312 aa  164  2e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1066  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.66 
 
 
304 aa  164  3e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.77 
 
 
298 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1678  aspartate carbamoyltransferase  37.9 
 
 
303 aa  163  4e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1387  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  32.91 
 
 
307 aa  163  4e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03647  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  34.07 
 
 
321 aa  162  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2092  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  34.27 
 
 
330 aa  162  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2154  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.22 
 
 
305 aa  162  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002419  aspartate carbamoyltransferase  33.74 
 
 
309 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1686  aspartate carbamoyltransferase  35.4 
 
 
309 aa  162  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.467419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1310  aspartate carbamoyltransferase  34.19 
 
 
353 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0959  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.04 
 
 
302 aa  161  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1339  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  34.63 
 
 
314 aa  160  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0931  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.69 
 
 
302 aa  159  9e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.189832  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0436  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  34.38 
 
 
311 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1158  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  34.38 
 
 
311 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0500  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  34.38 
 
 
311 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.879834  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1014  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.36 
 
 
302 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13562  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1285  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  34.63 
 
 
313 aa  156  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0519  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  32.81 
 
 
309 aa  155  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  34.63 
 
 
304 aa  155  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485741  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.02 
 
 
311 aa  154  3e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04077  hypothetical protein  33.02 
 
 
311 aa  154  3e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1821  aspartate carbamoyltransferase  34.9 
 
 
319 aa  153  3e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4501  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.02 
 
 
311 aa  154  3e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495681  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.02 
 
 
311 aa  154  3e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5767  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.02 
 
 
311 aa  154  3e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3749  aspartate carbamoyltransferase  33.02 
 
 
311 aa  154  3e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0024  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.36 
 
 
304 aa  154  3e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00458204 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2385  aspartate carbamoyltransferase  33.02 
 
 
337 aa  154  3e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000797149 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3766  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.02 
 
 
311 aa  154  3e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4726  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.02 
 
 
311 aa  154  3e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04113  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.02 
 
 
311 aa  154  3e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0028  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  35.26 
 
 
305 aa  152  6e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.44 
 
 
311 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0520  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.87 
 
 
305 aa  152  9e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06000  aspartate carbamoyltransferase, putative  34.71 
 
 
2333 aa  151  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00636164  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3465  aspartate carbamoyltransferase  33.33 
 
 
308 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1013  aspartate carbamoyltransferase  31.89 
 
 
339 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4744  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.87 
 
 
311 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1121  aspartate carbamoyltransferase  33.54 
 
 
304 aa  150  4e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00702877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.87 
 
 
311 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0447  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  32.2 
 
 
310 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015516 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4807  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.87 
 
 
311 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4713  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.87 
 
 
311 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465159  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1089  aspartate carbamoyltransferase  31.52 
 
 
339 aa  150  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0175924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0840  aspartate carbamoyltransferase  32.61 
 
 
339 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0065  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.86 
 
 
308 aa  149  9e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1256  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.97 
 
 
304 aa  149  1e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1160  aspartate carbamoyltransferase  31.87 
 
 
339 aa  147  2e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3152  aspartate carbamoyltransferase  31.87 
 
 
339 aa  147  2e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1205  aspartate carbamoyltransferase  31.87 
 
 
339 aa  147  2e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4842  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.56 
 
 
311 aa  147  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1238  aspartate carbamoyltransferase  31.87 
 
 
339 aa  147  2e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324325  normal  0.849044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.44 
 
 
298 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.934778  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2979  aspartate carbamoyltransferase  31.89 
 
 
339 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2750  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.11 
 
 
307 aa  146  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1301  aspartate carbamoyltransferase  31.46 
 
 
339 aa  146  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3070  aspartate carbamoyltransferase  31.46 
 
 
339 aa  146  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177283  hitchhiker  2.31142e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2974  aspartate carbamoyltransferase  31.56 
 
 
339 aa  145  7e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.771766  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1664  aspartate carbamoyltransferase  32.62 
 
 
317 aa  145  7e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2892  aspartate carbamoyltransferase  31.56 
 
 
339 aa  145  7e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  6.46707e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1120  aspartate carbamoyltransferase  31.56 
 
 
339 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0357  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  29.9 
 
 
304 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.127039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3735  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  32 
 
 
311 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1689  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  32.69 
 
 
298 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.417019  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0367  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.15 
 
 
311 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1631  aspartate carbamoyltransferase  33.23 
 
 
317 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2818  aspartate carbamoyltransferase  31.58 
 
 
339 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0185554  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2536  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  34.4 
 
 
298 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.69 
 
 
311 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0496  aspartate carbamoyltransferase  32.34 
 
 
334 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1172  aspartate carbamoyltransferase  31.27 
 
 
339 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.868394  hitchhiker  9.09543e-06 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0420  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.43 
 
 
311 aa  143  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0792  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  32.48 
 
 
303 aa  143  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.311854  hitchhiker  2.16134e-07 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3294  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.49 
 
 
311 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.773416  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0975  aspartate carbamoyltransferase  30.65 
 
 
339 aa  142  1e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4628  aspartate carbamoyltransferase  30.75 
 
 
337 aa  142  1e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1168  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  32.79 
 
 
308 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0258  aspartate carbamoyltransferase  31.23 
 
 
341 aa  140  3e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_19816  aspartate carbamoyltransferase  34.29 
 
 
355 aa  138  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.904682  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00485  aspartate carbamoyltransferase  32.6 
 
 
354 aa  136  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1305  aspartate carbamoyltransferase  37.14 
 
 
310 aa  136  6e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0534  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  32.48 
 
 
320 aa  135  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.726764  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0063  aspartate carbamoyltransferase  31.03 
 
 
343 aa  132  1e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.631606  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1204  aspartate carbamoyltransferase  29.84 
 
 
431 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4709  aspartate carbamoyltransferase  30.16 
 
 
431 aa  128  1e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4187  aspartate carbamoyltransferase  30.16 
 
 
431 aa  129  1e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1687  aspartate carbamoyltransferase  29.84 
 
 
431 aa  128  1e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>