276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0027 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  100 
 
 
413 aa  836  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  71.08 
 
 
429 aa  608  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  64.13 
 
 
412 aa  535  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.27 
 
 
412 aa  293  3e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  38.29 
 
 
409 aa  273  4e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  38.93 
 
 
409 aa  273  4e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.25 
 
 
415 aa  270  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  37.99 
 
 
425 aa  265  8e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  37.56 
 
 
409 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.83 
 
 
447 aa  259  5e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  35.59 
 
 
422 aa  243  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  37.65 
 
 
428 aa  242  7e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  33.5 
 
 
411 aa  241  2e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  34.88 
 
 
431 aa  239  6e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  37.71 
 
 
425 aa  239  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  34.88 
 
 
416 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  37.47 
 
 
429 aa  238  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  38.5 
 
 
430 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  34.63 
 
 
416 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  36.96 
 
 
414 aa  236  5e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  37.86 
 
 
421 aa  234  2e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.82 
 
 
419 aa  233  6e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  35.27 
 
 
424 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  38.55 
 
 
422 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  36.89 
 
 
415 aa  231  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  35.04 
 
 
415 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.5 
 
 
421 aa  226  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  37.44 
 
 
414 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  36.94 
 
 
479 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  34.72 
 
 
411 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.14 
 
 
420 aa  223  5e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.14 
 
 
420 aa  223  5e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  39.6 
 
 
437 aa  223  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  34.55 
 
 
415 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4127  allantoate amidohydrolase  35.75 
 
 
413 aa  223  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.638137  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.14 
 
 
418 aa  222  1e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  36.14 
 
 
419 aa  222  1e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  37.65 
 
 
415 aa  221  2e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  37.23 
 
 
426 aa  221  2e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  37.23 
 
 
426 aa  221  2e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  36.59 
 
 
414 aa  221  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.35 
 
 
407 aa  220  4e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  34.62 
 
 
426 aa  220  4e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 
426 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  35.9 
 
 
423 aa  219  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  34.54 
 
 
426 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.64 
 
 
415 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  34.77 
 
 
408 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  37.23 
 
 
442 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  33.41 
 
 
411 aa  217  3e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  39.05 
 
 
417 aa  217  3e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  32.2 
 
 
423 aa  217  3e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0554  allantoate amidohydrolase  35.75 
 
 
413 aa  217  3e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  34.3 
 
 
426 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_004310  BR0279  allantoate amidohydrolase  33.17 
 
 
415 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0293  allantoate amidohydrolase  32.93 
 
 
415 aa  216  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0374467  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  33.82 
 
 
420 aa  216  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 
425 aa  216  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.17 
 
 
430 aa  216  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  34.3 
 
 
426 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  34.3 
 
 
426 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  34.3 
 
 
426 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  34.24 
 
 
427 aa  215  1e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  32.77 
 
 
416 aa  215  1e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  33.98 
 
 
412 aa  215  1e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  34.47 
 
 
426 aa  214  2e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.49 
 
 
426 aa  214  3e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  33.99 
 
 
427 aa  213  3e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  35.66 
 
 
411 aa  214  3e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  36.71 
 
 
471 aa  213  4e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  36.71 
 
 
459 aa  213  4e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  36.71 
 
 
459 aa  213  4e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.65 
 
 
426 aa  213  5e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  35.04 
 
 
429 aa  213  6e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  34.56 
 
 
423 aa  213  6e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 
427 aa  213  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.84 
 
 
428 aa  212  8e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.87 
 
 
415 aa  212  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  34.06 
 
 
426 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  33.01 
 
 
420 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  32.76 
 
 
418 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  34.31 
 
 
423 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  35.28 
 
 
411 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  35.28 
 
 
411 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  35.28 
 
 
411 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  34.48 
 
 
427 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  35.28 
 
 
411 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0348  allantoate amidohydrolase  32.44 
 
 
415 aa  211  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  34.68 
 
 
411 aa  209  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  34.43 
 
 
411 aa  209  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.58 
 
 
424 aa  209  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  32.2 
 
 
416 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  34.43 
 
 
411 aa  209  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  34.68 
 
 
411 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  34.68 
 
 
411 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  34.88 
 
 
419 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  32.85 
 
 
416 aa  209  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  36.23 
 
 
420 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  34.48 
 
 
427 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  34.43 
 
 
411 aa  209  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>