More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0018 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0018  UspA domain protein  100 
 
 
162 aa  325  2e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  57.59 
 
 
150 aa  182  2e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0155  hypothetical protein  36.17 
 
 
177 aa  80.9  6e-15  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  30.63 
 
 
162 aa  66.6  1e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  31.08 
 
 
142 aa  67  1e-10  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 
306 aa  66.6  1e-10  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  32.65 
 
 
154 aa  66.2  2e-10  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  34.9 
 
 
180 aa  65.1  3e-10  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.01 
 
 
170 aa  62.8  2e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  29.22 
 
 
154 aa  62.4  2e-09  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.01 
 
 
170 aa  62.8  2e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  32.65 
 
 
147 aa  62.8  2e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  31.25 
 
 
184 aa  62  3e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  29.73 
 
 
288 aa  61.2  6e-09  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  35.67 
 
 
159 aa  61.2  6e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  34.46 
 
 
150 aa  60.8  7e-09  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 
155 aa  60.8  8e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  31.54 
 
 
146 aa  60.8  8e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
144 aa  60.1  1e-08  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  34.69 
 
 
169 aa  60.5  1e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.01 
 
 
157 aa  60.5  1e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  30.63 
 
 
175 aa  60.5  1e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  31.69 
 
 
142 aa  60.1  1e-08  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.43 
 
 
320 aa  59.3  2e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  27.97 
 
 
155 aa  59.7  2e-08  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  29.45 
 
 
282 aa  59.3  2e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  32.43 
 
 
169 aa  59.7  2e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  48.48 
 
 
146 aa  58.9  3e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.19 
 
 
150 aa  58.9  3e-08  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  4.892e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
138 aa  58.5  3e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.17 
 
 
153 aa  58.5  3e-08  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  29.93 
 
 
145 aa  58.5  4e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1488  UspA domain protein  31.03 
 
 
146 aa  58.2  5e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272512  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  31.82 
 
 
148 aa  57.8  6e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 
157 aa  57.8  6e-08  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  29.56 
 
 
212 aa  57.8  7e-08  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0542  hypothetical protein  28.17 
 
 
147 aa  57.4  7e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  32.67 
 
 
155 aa  57.4  8e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  29.53 
 
 
147 aa  57.4  9e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  42.86 
 
 
294 aa  56.6  1e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  50.91 
 
 
280 aa  57  1e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  44 
 
 
152 aa  56.6  1e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  37.09 
 
 
309 aa  56.6  1e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  29.68 
 
 
157 aa  57  1e-07  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  31.13 
 
 
150 aa  55.8  2e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  43.28 
 
 
128 aa  56.2  2e-07  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  32.24 
 
 
151 aa  56.2  2e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  27.62 
 
 
180 aa  55.8  2e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  25 
 
 
177 aa  56.2  2e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
155 aa  55.5  3e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  31.65 
 
 
151 aa  55.5  3e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  31.65 
 
 
151 aa  55.5  3e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
138 aa  55.5  3e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  31.37 
 
 
161 aa  55.5  3e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 
162 aa  55.5  3e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  32.65 
 
 
303 aa  55.1  4e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  38.03 
 
 
165 aa  55.1  4e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
164 aa  55.1  5e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  29.05 
 
 
159 aa  54.7  5e-07  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 
156 aa  54.7  5e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
137 aa  54.3  6e-07  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 
141 aa  54.3  6e-07  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  35.29 
 
 
314 aa  54.3  6e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.51 
 
 
158 aa  54.3  7e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  32.41 
 
 
153 aa  54.3  7e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.41 
 
 
153 aa  54.3  7e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.41 
 
 
153 aa  54.3  7e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
153 aa  54.3  7e-07  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  42.31 
 
 
289 aa  53.9  8e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  27.27 
 
 
145 aa  54.3  8e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  31.45 
 
 
151 aa  53.9  8e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  37.07 
 
 
118 aa  53.9  9e-07  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.88 
 
 
144 aa  53.9  9e-07  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  37.78 
 
 
305 aa  53.9  9e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  30.97 
 
 
149 aa  53.9  9e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  25.95 
 
 
182 aa  53.5  1e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  40 
 
 
154 aa  53.5  1e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 
155 aa  53.1  1e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  28.1 
 
 
148 aa  53.5  1e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  25.95 
 
 
182 aa  53.5  1e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  28.08 
 
 
152 aa  53.9  1e-06  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  29.05 
 
 
144 aa  53.5  1e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.81 
 
 
304 aa  53.1  1e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
151 aa  53.9  1e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  27.7 
 
 
144 aa  53.5  1e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  29.41 
 
 
155 aa  53.1  1e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 
155 aa  53.1  1e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  31.51 
 
 
207 aa  52.8  2e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5859  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
317 aa  52.4  2e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689351  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  52.8  2e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.89 
 
 
152 aa  52.8  2e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  43.4 
 
 
151 aa  52.8  2e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  30 
 
 
301 aa  53.1  2e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  27.21 
 
 
277 aa  52.8  2e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  26.81 
 
 
149 aa  52.8  2e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  34 
 
 
187 aa  52.8  2e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  29.53 
 
 
150 aa  52.8  2e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  30.61 
 
 
147 aa  52.8  2e-06  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  28.28 
 
 
152 aa  53.1  2e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  32.45 
 
 
152 aa  52.4  3e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>