226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0017 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  100 
 
 
500 aa  1019  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  57.38 
 
 
492 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  51.84 
 
 
488 aa  461  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  51.02 
 
 
503 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  50.2 
 
 
518 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  49.69 
 
 
507 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  48.26 
 
 
486 aa  440  1e-122  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  50.1 
 
 
518 aa  439  1e-122  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1396  hypothetical protein  48.22 
 
 
520 aa  438  1e-122  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  49.39 
 
 
505 aa  441  1e-122  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  49.29 
 
 
522 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  47.85 
 
 
496 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  48.48 
 
 
522 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  47.85 
 
 
486 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  48.35 
 
 
497 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  48.48 
 
 
522 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  48.48 
 
 
522 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  48.89 
 
 
522 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  47.18 
 
 
540 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  47.85 
 
 
486 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  47.79 
 
 
522 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  46.97 
 
 
498 aa  430  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  48.8 
 
 
540 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  48.56 
 
 
525 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  48.56 
 
 
521 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1864  hypothetical protein  49.6 
 
 
544 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1456  hypothetical protein  46.61 
 
 
529 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0629194  hitchhiker  9.11668e-05 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  46.61 
 
 
529 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  48.37 
 
 
525 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  48.37 
 
 
521 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  48.37 
 
 
525 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1748  hypothetical protein  48.39 
 
 
525 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735869  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  48.37 
 
 
525 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  48.37 
 
 
521 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  48.97 
 
 
483 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  47.88 
 
 
494 aa  416  1e-115  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  48.55 
 
 
483 aa  417  1e-115  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2027  protein of unknown function UPF0061  48.98 
 
 
495 aa  416  1e-115  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  49.18 
 
 
495 aa  418  1e-115  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  48.57 
 
 
487 aa  418  1e-115  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2140  hypothetical protein  48.37 
 
 
521 aa  415  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423999  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  46.76 
 
 
489 aa  413  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  45.68 
 
 
483 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  46.26 
 
 
489 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  45.68 
 
 
487 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  48.36 
 
 
508 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  46.42 
 
 
478 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4038  hypothetical protein  47.46 
 
 
499 aa  412  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  46.42 
 
 
478 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  45.85 
 
 
505 aa  406  1e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2935  protein of unknown function UPF0061  47.81 
 
 
494 aa  406  1e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0444  hypothetical protein  47.35 
 
 
487 aa  406  1e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734273  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5760  hypothetical protein  46.75 
 
 
486 aa  405  1e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  45.7 
 
 
480 aa  405  1e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  48.09 
 
 
494 aa  408  1e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0432954 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  47.05 
 
 
478 aa  405  1e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0971  hypothetical protein  44.61 
 
 
488 aa  406  1e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0558  hypothetical protein  46.73 
 
 
487 aa  406  1e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  3.59024e-06 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  46.84 
 
 
478 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  46.01 
 
 
480 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  46.33 
 
 
478 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  46.33 
 
 
478 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  46.33 
 
 
478 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1800  hypothetical protein  47.15 
 
 
476 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  45.81 
 
 
478 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2395  hypothetical protein  46.67 
 
 
496 aa  402  1e-110  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  46.62 
 
 
510 aa  400  1e-110  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  43.94 
 
 
485 aa  399  1e-110  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0494  hypothetical protein  47.05 
 
 
487 aa  399  1e-110  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66410  hypothetical protein  45.93 
 
 
486 aa  400  1e-110  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  45.68 
 
 
480 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5028  hypothetical protein  46.33 
 
 
487 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  45.68 
 
 
480 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  45.68 
 
 
480 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  45.51 
 
 
478 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  45.89 
 
 
480 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  45.68 
 
 
480 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  46.79 
 
 
505 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  45.4 
 
 
491 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  43.37 
 
 
484 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  43.37 
 
 
484 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  43.37 
 
 
484 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  45.33 
 
 
483 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  44.11 
 
 
483 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0262  hypothetical protein  44.01 
 
 
484 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0540554  normal  0.0168688 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0310  hypothetical protein  45.88 
 
 
499 aa  381  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0585  hypothetical protein  46.35 
 
 
504 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0330  hypothetical protein  43.79 
 
 
484 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  44.51 
 
 
498 aa  375  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1589  hypothetical protein  45.98 
 
 
521 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510421  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  43.41 
 
 
492 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2120  hypothetical protein  43.89 
 
 
473 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  47.17 
 
 
491 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  44.54 
 
 
502 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4038  hypothetical protein  44.02 
 
 
484 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  43.55 
 
 
500 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3645  hypothetical protein  43.58 
 
 
484 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.348897  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4063  hypothetical protein  44.22 
 
 
484 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145391  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  43.58 
 
 
491 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  44.47 
 
 
494 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>