More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0014 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0014  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 346 aa  694    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.292227 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0032  sensory transduction protein kinase AlgZ  38.1 
 
 		 364 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  38.86 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0126  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  35.14 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0064  histidine kinase internal region  35.26 
 
 		 360 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  33.74 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69480  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  35.53 
 
 		 358 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.168313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0278  sensory transduction protein kinase AlgZ  35.14 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  31.76 
 
 		 367 aa  155  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6008  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  34.87 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3532  histidine kinase internal region  32.75 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.928574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  34.46 
 
 		 349 aa  149  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1227  histidine kinase internal region  37.78 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  33.95 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  33.23 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1260  two-component system, sensor protein  37.78 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04139  two-component system sensor protein  35.81 
 
 		 350 aa  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.821661  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1711  histidine kinase internal protein  33.72 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.462992  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1362  histidine kinase internal region  33.92 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  32.61 
 
 		 578 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 357 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  35.34 
 
 		 465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  33.67 
 
 		 645 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3680  histidine kinase internal region  35.94 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3671  histidine kinase internal region  30.84 
 
 		 352 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1948  histidine kinase internal region  34.12 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  hitchhiker  0.00774821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5317  histidine kinase internal region  34.44 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.500348  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1112  putative two-component system sensor protein  43.43 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0563295  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  37.14 
 
 		 482 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3097  histidine kinase internal region  35.71 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0230  two-component system sensor ATPase  35.71 
 
 		 358 aa  116  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.779882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  36.7 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  32.51 
 
 		 572 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2665  histidine kinase internal region  39.09 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  32.51 
 
 		 572 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3313  histidine kinase internal region  39.09 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.569837  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  40.12 
 
 		 382 aa  112  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  34.84 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1434  histidine kinase internal region  34.32 
 
 		 369 aa  113  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675991  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  35.63 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  32.99 
 
 		 558 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  32.54 
 
 		 455 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  35.98 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  32.38 
 
 		 577 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  31.22 
 
 		 575 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  31.5 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3901  putative regulator of cell autolysis-like  29.07 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  34.42 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  30.5 
 
 		 558 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  41.67 
 
 		 557 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  41.67 
 
 		 557 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  41.67 
 
 		 557 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4847  signal transduction histidine kinase, LytS  31.58 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 428 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  32.23 
 
 		 561 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  32.23 
 
 		 561 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  32.23 
 
 		 561 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  32.23 
 
 		 561 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  32.96 
 
 		 556 aa  105  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  33.55 
 
 		 563 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1353  histidine kinase internal region  37.11 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  40.91 
 
 		 557 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  29.56 
 
 		 565 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  27.34 
 
 		 576 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3417  signal transduction histidine kinase, LytS  34.27 
 
 		 559 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.076956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 565 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  34.74 
 
 		 576 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4305  signal transduction histidine kinase, LytS  30.81 
 
 		 654 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.119677  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  29.61 
 
 		 565 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  30.36 
 
 		 559 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  35.18 
 
 		 394 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  32.81 
 
 		 556 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  34.34 
 
 		 394 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  32.52 
 
 		 561 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  38.89 
 
 		 831 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  30.58 
 
 		 560 aa  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  34.44 
 
 		 580 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  31.47 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  31.55 
 
 		 561 aa  102  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  39.39 
 
 		 557 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  39.39 
 
 		 557 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  31.86 
 
 		 561 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  28.9 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  29.11 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  34.74 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  29.69 
 
 		 561 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2452  signal transduction histidine kinase, LytS  26.32 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00298598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  30.2 
 
 		 563 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  29.81 
 
 		 562 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  36.49 
 
 		 603 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  32.95 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  29.67 
 
 		 568 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  36.71 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  32.26 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  32.12 
 
 		 557 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>