More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0013 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0013  two component transcriptional regulator, LytTR family  100 
 
 		 241 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.349161 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  42.26 
 
 		 243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 245 aa  144  9e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  37.65 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0279  two-component response regulator AlgR  38.65 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  37.65 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1113  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.29087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  36.21 
 
 		 245 aa  128  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3679  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69470  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  35.74 
 
 		 248 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.184834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5488  two-component response regulator AlgR  36.29 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6007  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  36.61 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3670  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5318  LytTR family two component transcriptional regulator  39.2 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2880  response regulator receiver protein  37.45 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313062  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3314  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 250 aa  118  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.742064  normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1226  LytTR family two component transcriptional regulator  34.18 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47610  encystment and alginate biosynthesis response regulator; AlgR  35.43 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2149  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.21 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00472108  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3668  two-component response regulator AlgR  33.61 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00827536  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1259  response regulator receiver protein  33.76 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0231  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3096  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1947  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 248 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.298927  decreased coverage  0.00301393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0036  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2666  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.46 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.65 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1712  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1363  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.27 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.63 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  32.49 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1435  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.16 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.314663  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0255  LytTR family two component transcriptional regulator  32.53 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  51.26 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.94 
 
 		 268 aa  99.8  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0207  LytTR family two component transcriptional regulator  30.92 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.22 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0210  LytTR family two component transcriptional regulator  30.92 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0185  LytTR family two component transcriptional regulator  30.92 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3089  LytTR family two component transcriptional regulator  34.22 
 
 		 278 aa  96.3  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.69 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0959  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.94 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1440  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.02 
 
 		 236 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 255 aa  95.1  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.67 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  31.52 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3416  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.1 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0577965 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  34.15 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2432  putative two-component response-regulatory protein YehT  42.02 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000158974  hitchhiker  0.00361478 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823  putative two-component response-regulatory protein YehT  42.02 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2502  putative two-component response-regulatory protein YehT  42.02 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00178929  normal  0.0452702 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1548  putative two-component response-regulatory protein YehT  40 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.496368  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2594  putative two-component response-regulatory protein YehT  42.02 
 
 		 236 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0103906  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  30.14 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2883  putative two-component response-regulatory protein YehT  40.52 
 
 		 236 aa  93.2  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000903631  unclonable  0.0000000000401288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1695  putative two-component response-regulatory protein YehT  40.83 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000884824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3531  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.25 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1658  putative two-component response-regulatory protein YehT  40.83 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2685  putative two-component response-regulatory protein YehT  40.83 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0538398  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0617  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.8 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1673  putative two-component response-regulatory protein YehT  40.83 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000537167  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.99 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.99 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.99 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.99 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.99 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1352  two-component response regulator transcription regulator protein  33.92 
 
 		 270 aa  92.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 276 aa  92  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.74 
 
 		 257 aa  92  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00984  putative two-component response-regulatory protein YehT  38.41 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0399  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.71 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1765  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.05 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.199181  hitchhiker  0.00544661 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0190  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.625509  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.08 
 
 		 256 aa  89.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0388  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.84 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1227  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.41 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299238  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.24 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0979  LytTR family two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238694 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  32.53 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0577  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.25 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0935  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 232 aa  89.4  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0957  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.53 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1083  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.19 
 
 		 239 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.450563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1318  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.37 
 
 		 238 aa  88.6  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2025  two-component response regulator  29.81 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1290  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.02 
 
 		 277 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.212023 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004414  response regulator of the LytR/AlgR family  38.66 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.14 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.15 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.09 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.09 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2603  response regulator  31.78 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3341  putative two-component response-regulatory protein YehT  38.58 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  35.16 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>