260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0011 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0011  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 
271 aa  547  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.458741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0028  Uroporphyrinogen-III synthase  61.66 
 
 
272 aa  314  8e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2689  uroporphyrinogen-III synthase  48.32 
 
 
260 aa  222  5e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3673  uroporphyrinogen-III synthase  46.61 
 
 
260 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2897  Uroporphyrinogen-III synthase  43.36 
 
 
262 aa  185  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116607  normal  0.0810585 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3299  uroporphyrinogen-III synthase  43.36 
 
 
262 aa  185  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.466839  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0034  uroporphyrinogen-III synthase  39.68 
 
 
256 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1438  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.1 
 
 
267 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0503  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.32 
 
 
265 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.36 
 
 
672 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2669  uroporphyrinogen-III synthase  39.52 
 
 
261 aa  156  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.90526e-10 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1026  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.39 
 
 
264 aa  139  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.928762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4203  uroporphyrinogen-III synthase  34.96 
 
 
246 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110892  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4319  uroporphyrinogen-III synthase  34.96 
 
 
246 aa  132  4e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0995416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4024  uroporphyrinogen-III synthase  34.96 
 
 
246 aa  132  4e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00563247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5242  uroporphyrinogen-III synthase  34.96 
 
 
246 aa  132  4e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4175  Uroporphyrinogen-III synthase  34.96 
 
 
246 aa  132  4e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.272222  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03628  hypothetical protein  34.96 
 
 
246 aa  132  7e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03679  uroporphyrinogen-III synthetase  34.96 
 
 
246 aa  132  7e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.398858  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4263  uroporphyrinogen-III synthase  34.55 
 
 
246 aa  132  8e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2567  uroporphyrinogen-III synthase  39.91 
 
 
252 aa  132  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4172  uroporphyrinogen-III synthase  35.66 
 
 
246 aa  131  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0344779  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4169  uroporphyrinogen-III synthase  34.55 
 
 
246 aa  131  1e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.534441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3988  uroporphyrinogen-III synthase  34.82 
 
 
246 aa  129  7e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3981  uroporphyrinogen-III synthase  35.25 
 
 
246 aa  129  7e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000864571  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4150  uroporphyrinogen-III synthase  34.94 
 
 
246 aa  128  9e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4165  uroporphyrinogen-III synthase  34.94 
 
 
246 aa  128  9e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000285608  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4267  uroporphyrinogen-III synthase  35.08 
 
 
246 aa  128  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4326  uroporphyrinogen-III synthase  34.94 
 
 
246 aa  128  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.975314 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0219  uroporphyrinogen III synthase HemD  31.42 
 
 
248 aa  128  1e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2661  uroporphyrinogen-III synthetase  34.91 
 
 
250 aa  127  2e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4219  uroporphyrinogen-III synthase  34.94 
 
 
246 aa  127  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.374545  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002105  uroporphyrinogen-III synthase  35.11 
 
 
242 aa  125  8e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.939405  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4134  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.94 
 
 
244 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2792  uroporphyrinogen-III synthetase  33.04 
 
 
250 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3410  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.2 
 
 
672 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0178  uroporphyrinogen-III synthase  34.55 
 
 
246 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0118658  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2178  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.46 
 
 
686 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280216  hitchhiker  0.000563849 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00315  uroporphyrinogen-III synthase  33.33 
 
 
242 aa  121  1e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1070  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.6 
 
 
672 aa  120  2e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2399  uroporphyrinogen-III synthase  34.93 
 
 
260 aa  119  4e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.659823  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2467  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.61 
 
 
655 aa  117  2e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0701  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.5 
 
 
689 aa  117  2e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2570  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.3 
 
 
702 aa  117  2e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69440  uroporphyrinogen-III synthase  32.1 
 
 
251 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0372  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.4 
 
 
243 aa  116  4e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2333  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.61 
 
 
655 aa  115  7e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.623737 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0439  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.9 
 
 
239 aa  113  4e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3255  uroporphyrinogen-III synthase  33.93 
 
 
239 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.82 
 
 
238 aa  112  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0482  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.59 
 
 
243 aa  112  8e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  32.09 
 
 
276 aa  111  1e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.90734e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1057  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.57 
 
 
505 aa  110  2e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0227  uroporphyrinogen-III synthase  32.24 
 
 
246 aa  110  2e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1028  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.44 
 
 
505 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6005  uroporphyrinogen-III synthase  32.2 
 
 
251 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5751  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.02 
 
 
656 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2356  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.75 
 
 
695 aa  108  7e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134951  normal  0.286784 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2173  uroporphyrinogen-III synthase  32.95 
 
 
268 aa  108  8e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0535  uroporphyrinogen-III synthase  33.6 
 
 
249 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0197  uroporphyrinogen-III synthase  33.6 
 
 
249 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00133341  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4017  uroporphyrinogen-III synthase  33.6 
 
 
249 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.405149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47590  uroporphyrinogen-III synthase  32.22 
 
 
262 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0317  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.08 
 
 
243 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4314  uroporphyrinogen-III synthase  32.89 
 
 
246 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0008  uroporphyrinogen-III synthase  32.58 
 
 
268 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0960218  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  37.14 
 
 
513 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0177  uroporphyrinogen-III synthase  32.52 
 
 
246 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.033755  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0486  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.47 
 
 
270 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0212  uroporphyrinogen-III synthase  34.52 
 
 
255 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475879  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1812  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.84 
 
 
656 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2424  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.84 
 
 
656 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0873  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.2 
 
 
659 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.94 
 
 
513 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3588  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.69 
 
 
246 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2428  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.84 
 
 
656 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.475486  normal  0.299485 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0385  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.67 
 
 
232 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.108763  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2165  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.78 
 
 
665 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.255779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3666  Na+/H+ antiporter NhaA  29.56 
 
 
290 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.232778  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.4 
 
 
509 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1078  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.61 
 
 
659 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1072  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.61 
 
 
659 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1596  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.61 
 
 
659 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447843  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3001  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.61 
 
 
659 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  36.89 
 
 
520 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1231  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.61 
 
 
659 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2283  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.61 
 
 
659 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0731  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.61 
 
 
659 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2748  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.64 
 
 
693 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0187  uroporphyrinogen-III synthase  33.73 
 
 
255 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3325  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.18 
 
 
512 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3639  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.43 
 
 
232 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0870  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.06 
 
 
656 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.787739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0209  uroporphyrinogen-III synthase  33.73 
 
 
255 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0061  uroporphyrinogen-III synthase  30.61 
 
 
257 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3902  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.46 
 
 
246 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.11 
 
 
232 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.8019  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.14 
 
 
266 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.47 
 
 
510 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3474  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.89 
 
 
517 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.027722  normal  0.984084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>