More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0007 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 
255 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  72.33 
 
 
255 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  68.75 
 
 
258 aa  364  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  68.38 
 
 
256 aa  360  8e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  62.06 
 
 
267 aa  332  4e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  62.06 
 
 
256 aa  323  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  60.87 
 
 
256 aa  318  4e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  59.06 
 
 
254 aa  317  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  60.39 
 
 
258 aa  315  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  61.96 
 
 
264 aa  314  9e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  59.38 
 
 
259 aa  313  1e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  61.57 
 
 
264 aa  312  3e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  60.34 
 
 
237 aa  308  7e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  58.5 
 
 
255 aa  305  4e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  58.27 
 
 
277 aa  303  3e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  56.69 
 
 
254 aa  302  4e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  57.83 
 
 
255 aa  299  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  2.98085e-05 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  55.13 
 
 
265 aa  298  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  56.27 
 
 
275 aa  296  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  58.98 
 
 
254 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  54.65 
 
 
258 aa  292  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  54.65 
 
 
258 aa  291  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  53.49 
 
 
258 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  53.49 
 
 
258 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  53.7 
 
 
322 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  53.49 
 
 
258 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  53.49 
 
 
258 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  53.49 
 
 
258 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  53.49 
 
 
258 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  54.51 
 
 
257 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  53.1 
 
 
258 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  54.94 
 
 
272 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  54.55 
 
 
258 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  53.97 
 
 
257 aa  289  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  54.47 
 
 
260 aa  289  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  55.64 
 
 
267 aa  288  5e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  55.12 
 
 
256 aa  288  8e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  59.44 
 
 
257 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  53.75 
 
 
258 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  54.55 
 
 
258 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  59.44 
 
 
257 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  55.29 
 
 
258 aa  286  3e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  54.55 
 
 
258 aa  286  3e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  55.34 
 
 
261 aa  285  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  53.36 
 
 
258 aa  285  6e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  53.36 
 
 
258 aa  285  6e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  55.51 
 
 
254 aa  283  2e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  52.17 
 
 
271 aa  282  3e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  52.17 
 
 
271 aa  282  3e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  55.34 
 
 
258 aa  278  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  55.34 
 
 
258 aa  278  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  51.87 
 
 
269 aa  277  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  51.14 
 
 
269 aa  273  1e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  51.14 
 
 
269 aa  273  2e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  52.55 
 
 
274 aa  272  4e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  54.55 
 
 
258 aa  261  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  49.82 
 
 
288 aa  261  8e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  47.1 
 
 
282 aa  258  7e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  47.89 
 
 
261 aa  256  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  47.39 
 
 
268 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  46.92 
 
 
260 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  46.21 
 
 
265 aa  241  7e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  44.27 
 
 
262 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  44.27 
 
 
262 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  46.15 
 
 
260 aa  234  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  41.83 
 
 
281 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  41.44 
 
 
281 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  45.74 
 
 
282 aa  221  7e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  43.41 
 
 
275 aa  221  1e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  43.02 
 
 
275 aa  220  2e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  42.91 
 
 
263 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  39.54 
 
 
281 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  45.24 
 
 
265 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  45.24 
 
 
265 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  45.49 
 
 
254 aa  215  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.02 
 
 
266 aa  215  6e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  42.25 
 
 
263 aa  213  3e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  42.47 
 
 
262 aa  213  3e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  44.19 
 
 
279 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  38.76 
 
 
281 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  40.7 
 
 
263 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  41.86 
 
 
276 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  44.78 
 
 
266 aa  208  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  39.69 
 
 
277 aa  208  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  41.86 
 
 
267 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  44.02 
 
 
263 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  44.49 
 
 
264 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.72901e-05  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  45.7 
 
 
289 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  43.63 
 
 
263 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  41.47 
 
 
266 aa  205  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  46.46 
 
 
262 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  42.64 
 
 
261 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  42.41 
 
 
260 aa  203  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  41.67 
 
 
264 aa  202  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  45.14 
 
 
260 aa  202  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1784  exodeoxyribonuclease III  43.08 
 
 
266 aa  201  1e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144543  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  43.02 
 
 
288 aa  201  1e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  43.58 
 
 
275 aa  200  2e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  40.16 
 
 
279 aa  199  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  43.41 
 
 
293 aa  198  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>