More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0006 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2051  oligopeptidase A  49.42 
 
 		 695 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347537  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  53.82 
 
 		 680 aa  752    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  53.82 
 
 		 680 aa  754    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  52.86 
 
 		 695 aa  724    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  53.44 
 
 		 683 aa  734    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  48.18 
 
 		 704 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  50.07 
 
 		 695 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  56.34 
 
 		 682 aa  780    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  48.26 
 
 		 706 aa  636    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  52.5 
 
 		 680 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  49.49 
 
 		 683 aa  729    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0159  oligopeptidase A  50.51 
 
 		 677 aa  701    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  51.25 
 
 		 679 aa  732    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  50.07 
 
 		 699 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  52.36 
 
 		 679 aa  744    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  52.42 
 
 		 683 aa  731    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1726  oligopeptidase A  50.07 
 
 		 699 aa  666    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0156  oligopeptidase A  46.05 
 
 		 683 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0141  oligopeptidase A  46.35 
 
 		 685 aa  637    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  52.99 
 
 		 683 aa  739    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  52.93 
 
 		 681 aa  721    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  52.65 
 
 		 680 aa  740    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  53.82 
 
 		 680 aa  754    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1298  oligopeptidase A  49.49 
 
 		 692 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.757231  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2433  oligopeptidase A  48.92 
 
 		 701 aa  642    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  53.38 
 
 		 680 aa  750    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1481  Oligopeptidase A  48.98 
 
 		 714 aa  646    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  49.93 
 
 		 699 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  54.72 
 
 		 679 aa  760    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  50.07 
 
 		 699 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  52.78 
 
 		 692 aa  724    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  52.21 
 
 		 680 aa  728    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5447  oligopeptidase A  49.71 
 
 		 695 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0089  oligopeptidase A  50 
 
 		 674 aa  638    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  53.82 
 
 		 680 aa  753    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  52.78 
 
 		 683 aa  761    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  53.38 
 
 		 680 aa  749    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2159  oligopeptidase A  50.22 
 
 		 695 aa  663    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2166  oligopeptidase A  50.66 
 
 		 677 aa  702    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2483  oligopeptidase A  48.01 
 
 		 703 aa  654    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  51.92 
 
 		 679 aa  739    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  50.36 
 
 		 700 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  61.06 
 
 		 686 aa  857    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  52.06 
 
 		 680 aa  743    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  52.36 
 
 		 679 aa  742    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  52.06 
 
 		 680 aa  723    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2674  oligopeptidase A  50.07 
 
 		 699 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  52.65 
 
 		 680 aa  740    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0031  oligopeptidase A  49.56 
 
 		 685 aa  686    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  52.5 
 
 		 680 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  51.99 
 
 		 679 aa  703    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  50.95 
 
 		 678 aa  734    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  48.2 
 
 		 716 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  52.21 
 
 		 679 aa  743    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  51.4 
 
 		 679 aa  733    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  51.4 
 
 		 679 aa  756    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  50.52 
 
 		 679 aa  725    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  55.44 
 
 		 694 aa  753    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1623  Oligopeptidase A  48.04 
 
 		 704 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.932062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  51.47 
 
 		 680 aa  729    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  53.82 
 
 		 680 aa  752    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0054  oligopeptidase A  45.97 
 
 		 695 aa  656    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  53.59 
 
 		 695 aa  738    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  51.18 
 
 		 679 aa  732    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  53.82 
 
 		 680 aa  753    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5936  oligopeptidase A  50.22 
 
 		 695 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00788443  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  50.07 
 
 		 699 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  52.79 
 
 		 680 aa  746    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  51.92 
 
 		 680 aa  747    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  51.4 
 
 		 680 aa  755    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  49.85 
 
 		 679 aa  717    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03135  oligopeptidase A  51.18 
 
 		 674 aa  655    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  51.55 
 
 		 695 aa  752    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2597  Oligopeptidase A  48.63 
 
 		 702 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219931  normal  0.0217228 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  53.68 
 
 		 680 aa  750    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  52.65 
 
 		 679 aa  751    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  53.82 
 
 		 680 aa  754    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  52.35 
 
 		 680 aa  742    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  54.95 
 
 		 681 aa  744    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  52.65 
 
 		 679 aa  751    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  57.99 
 
 		 679 aa  778    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  52.93 
 
 		 682 aa  735    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  52.65 
 
 		 680 aa  740    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  51.18 
 
 		 679 aa  753    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  53.82 
 
 		 680 aa  754    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2178  oligopeptidase A  49.28 
 
 		 695 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.61297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  54.95 
 
 		 681 aa  749    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  50.07 
 
 		 699 aa  666    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2141  oligopeptidase A  50.22 
 
 		 695 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388715  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  53.24 
 
 		 682 aa  746    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  52.65 
 
 		 679 aa  748    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  53.44 
 
 		 695 aa  735    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  52.8 
 
 		 679 aa  750    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  54.72 
 
 		 685 aa  716    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0122  oligopeptidase A  48.9 
 
 		 680 aa  702    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  52.06 
 
 		 679 aa  741    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  49.78 
 
 		 676 aa  696    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  53.02 
 
 		 678 aa  744    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  50.15 
 
 		 683 aa  716    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  52.86 
 
 		 681 aa  757    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>