More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0006 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  49.85 
 
 
679 aa  717  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2674  oligopeptidase A  50.07 
 
 
699 aa  666  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  50.07 
 
 
699 aa  666  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  51.4 
 
 
679 aa  733  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  52.06 
 
 
680 aa  743  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  52.35 
 
 
680 aa  742  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  52.21 
 
 
679 aa  743  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  52.93 
 
 
682 aa  735  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  53.82 
 
 
680 aa  752  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  51.4 
 
 
680 aa  755  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  53.44 
 
 
695 aa  735  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  51.47 
 
 
680 aa  729  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  49.78 
 
 
676 aa  696  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  54.95 
 
 
681 aa  744  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1623  Oligopeptidase A  48.04 
 
 
704 aa  635  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.932062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  52.65 
 
 
679 aa  748  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  50.07 
 
 
699 aa  667  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  52.21 
 
 
680 aa  728  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  52.06 
 
 
679 aa  741  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  52.06 
 
 
680 aa  723  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  52.65 
 
 
679 aa  751  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  52.65 
 
 
679 aa  751  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  57.99 
 
 
679 aa  778  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  51.18 
 
 
679 aa  753  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2178  oligopeptidase A  49.28 
 
 
695 aa  651  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.61297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  54.95 
 
 
681 aa  749  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2141  oligopeptidase A  50.22 
 
 
695 aa  664  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388715  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  52.8 
 
 
679 aa  750  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  53.02 
 
 
678 aa  744  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  50.15 
 
 
683 aa  716  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  52.86 
 
 
681 aa  757  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  50.07 
 
 
699 aa  666  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  54.72 
 
 
685 aa  716  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  50.07 
 
 
699 aa  666  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  53.24 
 
 
682 aa  746  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0159  oligopeptidase A  50.51 
 
 
677 aa  701  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2051  oligopeptidase A  49.42 
 
 
695 aa  652  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347537  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0089  oligopeptidase A  50 
 
 
674 aa  638  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  48.18 
 
 
704 aa  658  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  61.06 
 
 
686 aa  857  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  53.82 
 
 
680 aa  753  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2597  Oligopeptidase A  48.63 
 
 
702 aa  639  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219931  normal  0.0217228 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03135  oligopeptidase A  51.18 
 
 
674 aa  655  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  52.5 
 
 
680 aa  738  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  52.65 
 
 
680 aa  740  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  52.65 
 
 
680 aa  740  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  50.95 
 
 
678 aa  734  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  52.5 
 
 
680 aa  738  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  52.65 
 
 
680 aa  740  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0122  oligopeptidase A  48.9 
 
 
680 aa  702  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  53.82 
 
 
680 aa  753  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2159  oligopeptidase A  50.22 
 
 
695 aa  663  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  50.52 
 
 
679 aa  725  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  52.86 
 
 
695 aa  724  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  51.55 
 
 
695 aa  752  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  53.82 
 
 
680 aa  754  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  53.68 
 
 
680 aa  750  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  51.25 
 
 
679 aa  732  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  52.79 
 
 
680 aa  746  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  51.18 
 
 
679 aa  732  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  52.36 
 
 
679 aa  742  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  50.07 
 
 
695 aa  653  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2166  oligopeptidase A  50.66 
 
 
677 aa  702  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  53.38 
 
 
680 aa  750  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  53.59 
 
 
695 aa  738  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  53.38 
 
 
680 aa  749  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  53.82 
 
 
680 aa  754  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  52.93 
 
 
681 aa  721  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  53.82 
 
 
680 aa  754  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1481  Oligopeptidase A  48.98 
 
 
714 aa  646  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  52.99 
 
 
683 aa  739  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  50.36 
 
 
700 aa  674  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  100 
 
 
682 aa  1390  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  49.49 
 
 
683 aa  729  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2483  oligopeptidase A  48.01 
 
 
703 aa  654  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0031  oligopeptidase A  49.56 
 
 
685 aa  686  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  51.99 
 
 
679 aa  703  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  48.2 
 
 
716 aa  648  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  48.26 
 
 
706 aa  636  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  51.4 
 
 
679 aa  756  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  56.34 
 
 
682 aa  780  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  52.78 
 
 
683 aa  761  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5447  oligopeptidase A  49.71 
 
 
695 aa  650  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1298  oligopeptidase A  49.49 
 
 
692 aa  650  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.757231  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0156  oligopeptidase A  46.05 
 
 
683 aa  637  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2433  oligopeptidase A  48.92 
 
 
701 aa  642  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1726  oligopeptidase A  50.07 
 
 
699 aa  666  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  49.93 
 
 
699 aa  665  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  52.42 
 
 
683 aa  731  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  54.72 
 
 
679 aa  760  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  51.92 
 
 
679 aa  739  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  52.78 
 
 
692 aa  724  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  52.36 
 
 
679 aa  744  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  55.44 
 
 
694 aa  753  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0054  oligopeptidase A  45.97 
 
 
695 aa  656  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  53.82 
 
 
680 aa  752  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  51.92 
 
 
680 aa  747  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0141  oligopeptidase A  46.35 
 
 
685 aa  637  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5936  oligopeptidase A  50.22 
 
 
695 aa  664  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00788443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  53.82 
 
 
680 aa  754  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>