More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2692 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  55.26 
 
 		 535 aa  645    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2692  CTP synthetase  100 
 
 		 536 aa  1107    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  55.43 
 
 		 535 aa  639    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  55.64 
 
 		 535 aa  648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  55.26 
 
 		 535 aa  645    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  58.27 
 
 		 533 aa  662    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  55.45 
 
 		 535 aa  647    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  55.45 
 
 		 535 aa  647    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  55.26 
 
 		 535 aa  646    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  56.55 
 
 		 540 aa  648    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  58.22 
 
 		 531 aa  672    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  55.83 
 
 		 535 aa  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  59.93 
 
 		 542 aa  689    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  56.33 
 
 		 545 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  59.13 
 
 		 541 aa  679    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  58.25 
 
 		 533 aa  659    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  55.97 
 
 		 536 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  55.45 
 
 		 535 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  56.23 
 
 		 537 aa  646    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  55.97 
 
 		 536 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  55.26 
 
 		 535 aa  646    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  55.08 
 
 		 535 aa  643    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  56.39 
 
 		 532 aa  642    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  59.18 
 
 		 534 aa  675    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  56.45 
 
 		 536 aa  645    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  55.45 
 
 		 535 aa  647    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  55.26 
 
 		 542 aa  635    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  56.71 
 
 		 531 aa  658    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  55.74 
 
 		 547 aa  643    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  55.74 
 
 		 547 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  55.74 
 
 		 535 aa  634  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  55.74 
 
 		 536 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  54.87 
 
 		 546 aa  634  1e-180  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  54.34 
 
 		 558 aa  631  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  56.06 
 
 		 536 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  55.28 
 
 		 536 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  54.61 
 
 		 534 aa  630  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  55.01 
 
 		 557 aa  629  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  54.82 
 
 		 555 aa  630  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  55.64 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  55.64 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  55.39 
 
 		 545 aa  631  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  55.01 
 
 		 547 aa  627  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  54.91 
 
 		 536 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  54.43 
 
 		 571 aa  624  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  53.79 
 
 		 549 aa  619  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  56.06 
 
 		 559 aa  620  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  55.81 
 
 		 537 aa  616  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  53.98 
 
 		 549 aa  616  1e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  55.35 
 
 		 533 aa  617  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  52.63 
 
 		 534 aa  615  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000736967  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl648  CTP synthetase  55.64 
 
 		 532 aa  613  9.999999999999999e-175  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  53.98 
 
 		 555 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  54.17 
 
 		 534 aa  610  1e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  53.72 
 
 		 536 aa  608  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  53.79 
 
 		 547 aa  609  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  53.79 
 
 		 555 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  52.84 
 
 		 551 aa  608  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  51.93 
 
 		 546 aa  609  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  53.93 
 
 		 536 aa  608  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2240  CTP synthase  52.35 
 
 		 538 aa  605  9.999999999999999e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.480031  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  53.41 
 
 		 558 aa  608  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  54.39 
 
 		 549 aa  608  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  53.42 
 
 		 547 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  54.33 
 
 		 542 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  53.7 
 
 		 555 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  51.79 
 
 		 534 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  53.94 
 
 		 546 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  54.04 
 
 		 553 aa  598  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  51.5 
 
 		 534 aa  599  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  53.79 
 
 		 550 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  53.35 
 
 		 538 aa  599  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  51.94 
 
 		 548 aa  599  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  54.8 
 
 		 533 aa  599  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  52.55 
 
 		 555 aa  598  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0226  CTP synthetase  52.35 
 
 		 540 aa  599  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000246238  hitchhiker  4.1491499999999996e-20 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  51.88 
 
 		 534 aa  598  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  55.22 
 
 		 545 aa  600  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  54.43 
 
 		 531 aa  597  1e-169  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  53.88 
 
 		 554 aa  597  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  53.06 
 
 		 544 aa  597  1e-169  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  52.26 
 
 		 538 aa  598  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  53.56 
 
 		 533 aa  597  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  52.88 
 
 		 544 aa  597  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  52.25 
 
 		 534 aa  595  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  51.92 
 
 		 557 aa  595  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  52.81 
 
 		 555 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  52.62 
 
 		 533 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  53.15 
 
 		 558 aa  594  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0552  CTP synthetase  52.02 
 
 		 542 aa  592  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  50.74 
 
 		 542 aa  588  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  52.26 
 
 		 530 aa  589  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  51.85 
 
 		 555 aa  586  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25420  CTP synthetase  51.11 
 
 		 566 aa  585  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199429 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  51.75 
 
 		 543 aa  588  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0133  CTP synthetase  53.4 
 
 		 532 aa  585  1e-166  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  51.02 
 
 		 608 aa  585  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  53.18 
 
 		 555 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  51.88 
 
 		 544 aa  585  1e-166  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  52.06 
 
 		 533 aa  588  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>