192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2554 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2554  heat shock protein 34  100 
 
 
292 aa  600  1.0000000000000001e-171  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1374  Hsp33 protein  32.23 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000113565  hitchhiker  0.0000000423891 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1282  Hsp33-like chaperonin  32.41 
 
 
305 aa  132  5e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2900  Hsp33 protein  29.23 
 
 
292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000174602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1343  Hsp33 protein  29.02 
 
 
294 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000573361  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0204  Hsp33 protein  30.24 
 
 
297 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.1321  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1195  Hsp33-like chaperonin  31.29 
 
 
305 aa  122  8e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.688399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0066  Hsp33-like chaperonin  28.62 
 
 
295 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000194487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0950  Hsp33 protein  30.36 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000811074  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0062  Hsp33-like chaperonin  27.86 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3840  Hsp33 protein  29.27 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000889682  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3417  Hsp33 protein  28.47 
 
 
292 aa  119  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1868  Hsp33-like chaperonin  30.8 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24260  disulfide bond chaperone  29.15 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2157  Hsp33-like chaperonin  30.43 
 
 
319 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1852  Hsp33 protein  28.32 
 
 
296 aa  115  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000569764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0062  Hsp33-like chaperonin  27.21 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1272  Hsp33-like chaperonin  31.36 
 
 
300 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0064  Hsp33-like chaperonin  27.64 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0534  Hsp33-like chaperonin  27.03 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3554  Hsp33-like chaperonin  26.81 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3620  Hsp33-like chaperonin  26.45 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0547  Hsp33-like chaperonin  27.03 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0151  Hsp33-like chaperonin  27.5 
 
 
293 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0277  redox-related putative chaperone  28.78 
 
 
288 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0269  Hsp33-like chaperonin  26.99 
 
 
306 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0065  Hsp33-like chaperonin  27.47 
 
 
291 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0066  Hsp33-like chaperonin  27.47 
 
 
291 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0062  Hsp33-like chaperonin  27.47 
 
 
291 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0062  Hsp33-like chaperonin  27.47 
 
 
291 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0078  Hsp33-like chaperonin  27.47 
 
 
291 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.486635  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0066  Hsp33-like chaperonin  27.47 
 
 
291 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.77319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2063  Hsp33-like chaperonin  29.67 
 
 
294 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0075  Hsp33-like chaperonin  27.47 
 
 
291 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.05774 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0230  Hsp33-like chaperonin  26.79 
 
 
288 aa  107  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.193861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3348  Hsp33-like chaperonin  27.41 
 
 
301 aa  106  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.923438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0041  Hsp33-like chaperonin  27.37 
 
 
301 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0074  Hsp33-like chaperonin  27.11 
 
 
291 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.638833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5242  Hsp33-like chaperonin  27.11 
 
 
291 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0777269 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0097  Hsp33-like chaperonin  29.07 
 
 
299 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.708069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3228  Hsp33 protein  25.96 
 
 
291 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07221  Hsp33-like chaperonin  29.07 
 
 
299 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409809 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1050  Hsp33 protein  29.63 
 
 
295 aa  102  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5185  Hsp33-like chaperonin  29.68 
 
 
299 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000472348 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0258  Hsp33 protein  28.29 
 
 
297 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000999551  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15846  predicted protein  29.86 
 
 
291 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622688  normal  0.718386 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2817  Hsp33 protein  29.47 
 
 
308 aa  99.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07181  Hsp33-like chaperonin  28.72 
 
 
302 aa  99  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.244021  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1023  Hsp33 protein  27.82 
 
 
301 aa  99  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2283  Hsp33-like chaperonin  28.97 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1824  Hsp33-like chaperonin  24.73 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07201  Hsp33-like chaperonin  28.37 
 
 
302 aa  95.9  7e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07381  Hsp33-like chaperonin  28.47 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0559  Hsp33-like chaperonin  28.37 
 
 
297 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.136601  normal  0.555659 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1435  Hsp33 protein  28.78 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3383  Hsp33 protein  29.03 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.133262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0022  Hsp33 protein  27 
 
 
240 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1389  Hsp33 protein  28.41 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07751  Hsp33-like chaperonin  25.83 
 
 
300 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056735 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2869  Hsp33-like chaperonin  29.62 
 
 
301 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3227  Hsp33-like chaperonin  29.62 
 
 
301 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.23939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4200  Hsp33-like chaperonin  29.08 
 
 
301 aa  92.4  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0665  Hsp33-like chaperonin  27.56 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.294105  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0278  Hsp33-like chaperonin  26.45 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.175456  normal  0.0234968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0369  Hsp33 protein  24.48 
 
 
284 aa  89.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0218109  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2399  Hsp33 protein  29.82 
 
 
344 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2209  Hsp33-like chaperonin  25.09 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1493  Hsp33 protein  24.38 
 
 
289 aa  85.5  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.364161  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33525  predicted protein  23.67 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0302  Hsp33 protein  27.21 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10630  Hsp33 protein  25.66 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000018588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0755  Hsp33 protein  26.98 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  26.76 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0189  disulfide bond chaperones of the HSP33 family  24.01 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.8305  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0553  Hsp33 protein  27.17 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  25.09 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  24.73 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  24.73 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  24.73 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  24.73 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0405  disulfide bond chaperones of the HSP33 family  24.69 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  21.91 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1234  Hsp33-like chaperonin  26.58 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  23.86 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  25.44 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  25.17 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  24.65 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  24.11 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  24.11 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  24.11 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  24.11 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  22.89 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  24.11 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  24.11 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  24.11 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  24.11 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  23.76 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0166  Hsp33-like chaperonin  24.2 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210255  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  22.89 
 
 
281 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3139  Hsp33 protein  26.21 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>