66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2533 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  778  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  23.08 
 
 
397 aa  80.5  5e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  24.56 
 
 
406 aa  69.3  1e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 
395 aa  64.3  4e-09  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  25 
 
 
386 aa  64.3  4e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  22.5 
 
 
374 aa  62.4  1e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  25.52 
 
 
406 aa  62  2e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  3.12687e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  25.52 
 
 
406 aa  62  2e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  8.55622e-11 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  26.26 
 
 
407 aa  61.2  3e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.23123e-10  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  25.52 
 
 
406 aa  60.8  4e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  7.29069e-08 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  25.6 
 
 
326 aa  60.1  7e-08  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  29.17 
 
 
388 aa  58.2  2e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  24.23 
 
 
406 aa  58.5  2e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.04378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  24.34 
 
 
394 aa  58.2  2e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  29.17 
 
 
391 aa  58.2  3e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 
394 aa  58.2  3e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3127  transport protein  26.28 
 
 
421 aa  57.4  4e-07  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  24.88 
 
 
390 aa  56.6  7e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 
406 aa  56.6  7e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  23.94 
 
 
379 aa  56.2  1e-06  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  25.65 
 
 
394 aa  56.2  1e-06  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  23.32 
 
 
406 aa  56.2  1e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0723  major facilitator transporter  21.67 
 
 
404 aa  55.1  2e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.475957 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  28.21 
 
 
408 aa  55.5  2e-06  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  25.81 
 
 
433 aa  55.1  2e-06  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4635  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 
426 aa  54.7  3e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0839112  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  23.06 
 
 
406 aa  54.7  3e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  22.81 
 
 
390 aa  53.9  5e-06  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  22.61 
 
 
415 aa  52  2e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1651  major facilitator transporter  25 
 
 
422 aa  51.2  3e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0839039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 
388 aa  50.4  5e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  26.49 
 
 
399 aa  50.1  6e-05  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  26.78 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  21.25 
 
 
398 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  26.89 
 
 
405 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1636  major facilitator transporter  21.92 
 
 
480 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0364  major facilitator transporter  21.17 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  22.75 
 
 
384 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  23.67 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  22.18 
 
 
393 aa  47.8  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  24.02 
 
 
507 aa  47.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0872  major facilitator superfamily MFS_1  21.27 
 
 
405 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0910499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  25.91 
 
 
395 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  22.42 
 
 
422 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  24 
 
 
397 aa  47  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0878  major facilitator transporter  25.93 
 
 
401 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  24.51 
 
 
404 aa  46.6  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 
451 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.78504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3472  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.2382  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  24.02 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  25.53 
 
 
425 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  5.6973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  24.4 
 
 
440 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  22.39 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  25.61 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  23.44 
 
 
432 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  25.61 
 
 
414 aa  43.9  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
446 aa  43.9  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.04713e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  19.52 
 
 
426 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
393 aa  43.1  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03264  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03320)  27.84 
 
 
571 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.591417 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  21.89 
 
 
419 aa  43.1  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  22.78 
 
 
455 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  24.85 
 
 
459 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  28.41 
 
 
407 aa  42.7  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  7.8531e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  21.28 
 
 
428 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>