More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2500 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2500  DJ-1 family protein  100 
 
 
184 aa  367  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0133891  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0371  DJ-1 family protein  37.64 
 
 
181 aa  125  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00995133  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0966  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  38.6 
 
 
182 aa  120  9e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000883438  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1633  protein ThiJ  40.22 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  38.12 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0640  putative 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  36.21 
 
 
184 aa  119  3.9999999999999996e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00127997  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  36.81 
 
 
181 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  36.46 
 
 
181 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  37.22 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  35.96 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0481  DJ-1 family protein  33.69 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.476054  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  36.26 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  35.16 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  36.72 
 
 
179 aa  107  9.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0843  ThiJ/PfpI domain protein  38.17 
 
 
183 aa  105  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1780  DJ-1  39.55 
 
 
185 aa  105  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  37.77 
 
 
187 aa  105  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  38.73 
 
 
191 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  38.15 
 
 
191 aa  101  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1314  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.43 
 
 
185 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.02067e-17 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3290  DJ-1 family protein  39.31 
 
 
184 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0833  DJ-1 family protein  37.85 
 
 
183 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620178  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2146  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.43 
 
 
185 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.21104e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2085  ThiJ/PfpI domain protein  35.67 
 
 
185 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2774  DJ-1 family protein  38.6 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4036  DJ-1 family protein  35.43 
 
 
183 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0634  ThiJ/PfpI family protein  33.7 
 
 
181 aa  99  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.403728 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0326  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  35.2 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000260198  hitchhiker  6.98835e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1190  ThiJ/PfpI domain protein  34.43 
 
 
185 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00457983  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  35.2 
 
 
182 aa  99  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  34.46 
 
 
388 aa  98.2  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1523  DJ-1 family protein  35.11 
 
 
190 aa  97.1  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  35.68 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2091  ThiJ/PfpI domain protein  33.71 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.616699  hitchhiker  3.51942e-22 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1009  DJ-1 family protein  36.61 
 
 
183 aa  95.5  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047613  normal  0.605199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4895  DJ-1  35.71 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0083  ThiJ/PfpI domain protein  31.98 
 
 
195 aa  94.7  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1208  DJ-1 family protein  34.52 
 
 
188 aa  94  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  33.51 
 
 
185 aa  92.8  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4150  ThiJ/PfpI domain protein  30.77 
 
 
191 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4431  ThiJ/PfpI domain protein  31.15 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2477  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.55 
 
 
185 aa  92.8  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0941  protein ThiJ  35 
 
 
196 aa  92.4  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.963617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1082  DJ-1 family protein  34.24 
 
 
196 aa  91.7  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2354  DJ-1 family protein  33.51 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0457203  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  33.15 
 
 
190 aa  89.7  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0065  ThiJ/PfpI domain protein  30.49 
 
 
191 aa  89.4  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0510  DJ-1 family protein  35.23 
 
 
182 aa  87.8  8e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000981591  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3081  DJ-1 family protein  34.44 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.713776  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  32.6 
 
 
194 aa  85.9  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32791  predicted protein  30.11 
 
 
191 aa  85.1  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2019  DJ-1 family protein  37.21 
 
 
184 aa  85.1  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.236764  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0832  DJ-1 family protein  32.45 
 
 
180 aa  84.3  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0233882 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  30.23 
 
 
203 aa  84.3  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  30.23 
 
 
203 aa  84.3  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2890  DJ-1 family protein  33.33 
 
 
196 aa  84  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0623  DJ-1 family protein  33.52 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.226753  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3107  DJ-1 family protein  32.07 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03289  hypothetical protein  33.71 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3249  DJ-1 family protein  32.07 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3277  DJ-1 family protein  34.68 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0891  DJ-1 family protein  32.43 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915837  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3069  DJ-1 family protein  32.07 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2034  DJ-1 family protein  36 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002695  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis enzyme  33.71 
 
 
199 aa  80.9  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  30.77 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1238  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis protein-like  39.88 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  29.67 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3363  ThiJ/PfpI-family thiamine biogenesis protein  29.17 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0928  DJ-1/PfpI family protein  29.17 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.17 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00372  hypothetical protein  30.98 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0346  DJ-1 family protein  30.98 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0460  DJ-1 family protein  30.98 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0456  DJ-1 family protein  30.98 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00376  hypothetical protein  30.98 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0496  DJ-1 family protein  30.98 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0508  DJ-1 family protein  30.98 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44518  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3185  DJ-1 family protein  30.98 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3209  DJ-1 family protein  30.98 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000549408 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1034  DJ-1 family protein  33.53 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.02 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  34.48 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_127  DJ-1, 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  29.12 
 
 
180 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl263  putative intracellular protease/amidase  28.42 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.04249e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  31.84 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  33.33 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  31.84 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  31.84 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44270  predicted protein  31.38 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0563651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  32.45 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  30.64 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  29.61 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0493  DJ-1 family protein  32.43 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  30.86 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1895  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  30.23 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  29.61 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0914  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  29.12 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  31.79 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0978  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  28.57 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>