More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2403 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
213 aa  439  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 
208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  39.62 
 
 
212 aa  129  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  34.6 
 
 
209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  36.02 
 
 
210 aa  121  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 
209 aa  118  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  35.62 
 
 
212 aa  118  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  35.94 
 
 
210 aa  117  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  39.58 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  38.1 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  36.15 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  35.81 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.7 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  31.63 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  39.07 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  35.81 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  34.76 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  34.88 
 
 
209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 
209 aa  112  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  34.88 
 
 
209 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  35.35 
 
 
209 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  34.88 
 
 
209 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  34.88 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  39.38 
 
 
213 aa  112  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  34.88 
 
 
209 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.15 
 
 
211 aa  111  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  36.98 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 
251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  36.67 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  35.68 
 
 
211 aa  109  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
207 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  35.35 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  35.35 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  34.42 
 
 
213 aa  108  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  35.44 
 
 
222 aa  108  6e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 
303 aa  108  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  33.17 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 
237 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 
209 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  37.69 
 
 
229 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  36.13 
 
 
216 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  33.01 
 
 
211 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 
210 aa  106  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  37.5 
 
 
231 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  34.12 
 
 
219 aa  105  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  34.2 
 
 
207 aa  105  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.9 
 
 
205 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 
209 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  32.57 
 
 
210 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  35.23 
 
 
213 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.36 
 
 
216 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  38.31 
 
 
218 aa  102  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  37.07 
 
 
207 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  35.6 
 
 
206 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  38.27 
 
 
234 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  35.83 
 
 
218 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  35.6 
 
 
206 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 
214 aa  101  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  37.17 
 
 
213 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 
217 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 
198 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  37.7 
 
 
213 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  34.9 
 
 
215 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  34.76 
 
 
218 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  34.9 
 
 
215 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 
213 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.71 
 
 
222 aa  100  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  34.9 
 
 
215 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  34.9 
 
 
215 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  34.9 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  34.9 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  34.76 
 
 
201 aa  99  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.39 
 
 
212 aa  99  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  33.68 
 
 
215 aa  99  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  34.39 
 
 
214 aa  99  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  32.99 
 
 
210 aa  99  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  33.7 
 
 
217 aa  99  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  35.26 
 
 
212 aa  98.6  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 
206 aa  98.6  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  34.7 
 
 
225 aa  98.6  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  36.99 
 
 
225 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.9 
 
 
215 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.9 
 
 
215 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.9 
 
 
215 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.9 
 
 
215 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.9 
 
 
215 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  34.38 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  34.38 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  34.38 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  34.22 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 
207 aa  98.2  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 
207 aa  98.2  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  34.22 
 
 
215 aa  98.2  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 
258 aa  98.2  9e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0406  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.18 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>