34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2399 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2399  ribonuclease P protein component  100 
 
 
118 aa  239  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.71543  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
118 aa  60.5  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  32.41 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  32.77 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  34.44 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  34.44 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  28.57 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  34.44 
 
 
120 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  30.23 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  34.44 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  33.33 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  35.23 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  33.33 
 
 
118 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  32.22 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  35.23 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  33.33 
 
 
118 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000190839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  33.33 
 
 
118 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000794478  unclonable  0.00000000000188803 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  33.33 
 
 
118 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021378  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  33.33 
 
 
118 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  33.71 
 
 
118 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  32.22 
 
 
118 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  32.22 
 
 
118 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  32.22 
 
 
118 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  29.59 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  29.79 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  29.79 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  28.42 
 
 
117 aa  43.5  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  29.03 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  27.27 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0447  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
119 aa  42  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  27.78 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  30.43 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  23.85 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  32.05 
 
 
119 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>