More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2339 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0459  leucyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
821 aa  640  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0764  leucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
860 aa  653  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0705  leucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
860 aa  653  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2912  leucyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
880 aa  654  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 
807 aa  870  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 
806 aa  871  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf171  leucyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
804 aa  745  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 
806 aa  875  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
923 aa  734  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
825 aa  780  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 
805 aa  883  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0244  leucyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 
607 aa  644  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 
826 aa  766  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01874  leucyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 
880 aa  648  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2983  leucyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
877 aa  647  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.957955  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3380  leucyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
944 aa  648  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  1.07605e-07 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0609  leucyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
860 aa  650  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212281  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0808  leucyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 
860 aa  650  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01672  leucyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
867 aa  672  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
854 aa  768  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  56.38 
 
 
840 aa  973  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
856 aa  777  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 
802 aa  980  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  49.55 
 
 
899 aa  829  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1098  leucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
859 aa  672  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.77445e-09 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1202  leucyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
875 aa  652  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
810 aa  812  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 
802 aa  978  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
806 aa  756  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0731  leucyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
860 aa  652  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0463588  normal  0.765619 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0619  leucyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
821 aa  640  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0751  leucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
860 aa  653  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0691  leucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
860 aa  653  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.229457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
824 aa  755  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2819  leucyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
832 aa  717  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
857 aa  862  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 
835 aa  964  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2588  leucyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
864 aa  657  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224639  hitchhiker  2.06331e-09 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08751  leucyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
872 aa  709  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.115344  hitchhiker  0.00155899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
814 aa  775  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
952 aa  750  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
865 aa  731  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
1016 aa  644  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
868 aa  671  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1207  leucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
860 aa  664  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.338789  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
863 aa  677  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.60913e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0668  leucyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
860 aa  651  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00449058  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0694  leucyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
860 aa  648  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28668  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01222  leucyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
862 aa  665  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
904 aa  717  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  8.64885e-05 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
820 aa  690  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1280  leucyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
870 aa  651  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
819 aa  780  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0710  leucyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
821 aa  644  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.699276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
874 aa  675  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
807 aa  779  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1309  leucyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
879 aa  648  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  50.28 
 
 
857 aa  842  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1376  leucyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
879 aa  651  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.264613  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
859 aa  687  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  5.16313e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0627  leucyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
868 aa  693  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339775  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0662  leucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
860 aa  647  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0168621  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
824 aa  785  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3003  leucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
860 aa  652  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27573  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3015  leucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
860 aa  674  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.652989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
826 aa  731  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
868 aa  697  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
816 aa  787  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  55.94 
 
 
802 aa  968  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1842  leucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
860 aa  674  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
820 aa  687  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
828 aa  762  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2926  leucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
860 aa  674  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.454668  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3090  leucyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 
834 aa  720  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
859 aa  769  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
829 aa  737  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13250  leucyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
978 aa  715  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0736  leucyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
865 aa  743  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0349  leucyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
865 aa  700  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1582  leucyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
838 aa  702  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708157  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 
906 aa  920  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004217  leucyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
857 aa  662  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.07673e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
951 aa  719  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
854 aa  891  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1744  leucyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
818 aa  658  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.123788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3144  leucyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
860 aa  655  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 
805 aa  984  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
824 aa  777  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
978 aa  724  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
831 aa  717  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3306  leucyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
828 aa  761  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.02477e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1009  leucyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
816 aa  784  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
990 aa  679  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04530  leucyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
944 aa  716  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1033  leucyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
875 aa  746  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3332  leucyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
831 aa  671  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2429  leucyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
820 aa  704  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.83241 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 
952 aa  716  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2234  leucyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
982 aa  714  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0120653 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2055  leucyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
853 aa  723  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>