More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2339 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 860 aa  651    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2984  leucyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 860 aa  651    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 819 aa  800    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 813 aa  758    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 824 aa  750    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 868 aa  694    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 925 aa  731    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 858 aa  1783    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 804 aa  978    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1453  leucyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 887 aa  685    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.721273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2744  leucyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 877 aa  641    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.775327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 802 aa  978    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 863 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 833 aa  960    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 859 aa  677    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 868 aa  687    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 802 aa  978    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 802 aa  978    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 801 aa  784    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 802 aa  978    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2453  leucyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 864 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.484774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 823 aa  651    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 823 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 868 aa  687    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0576  leucyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 921 aa  636    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.931447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0544  leucyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 876 aa  641    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 830 aa  700    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 862 aa  724    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1229  leucyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 864 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09711  leucyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 864 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.217305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 872 aa  786    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3451  leucyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 913 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 819 aa  701    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4957  leucyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 868 aa  682    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 851 aa  746    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 805 aa  853    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 884 aa  715    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 805 aa  877    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 875 aa  713    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 824 aa  752    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 829 aa  730    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 877 aa  709    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 802 aa  978    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0911  leucyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 856 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168509  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 865 aa  781    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0511  leucyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 866 aa  697    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 804 aa  799    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3631  leucyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 862 aa  662    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 829 aa  812    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1211  leucyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 882 aa  643    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 858 aa  728    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3215  leucyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 848 aa  670    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 862 aa  720    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0758  leucyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 892 aa  642    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 819 aa  686    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 817 aa  683    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 859 aa  769    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0576  leucyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 863 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 872 aa  663    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2344  leucyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 856 aa  664    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.633045  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09721  leucyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 856 aa  687    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90709  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0566  leucyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 934 aa  651    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.632616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2973  leucyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 873 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0232  leucyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 861 aa  651    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 		 856 aa  695    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 819 aa  719    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0045  leucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 857 aa  643    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.269909 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0370  leucyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 864 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 971 aa  766    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 817 aa  755    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 870 aa  661    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 864 aa  682    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 816 aa  766    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 816 aa  781    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 860 aa  678    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 929 aa  675    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 859 aa  677    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 859 aa  680    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 864 aa  700    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 872 aa  669    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 824 aa  790    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 817 aa  675    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12230  leucyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 873 aa  676    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.726587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 		 829 aa  930    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 829 aa  894    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 		 804 aa  911    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 808 aa  916    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 		 833 aa  958    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 843 aa  711    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 829 aa  741    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 829 aa  692    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 859 aa  704    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 859 aa  679    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0771  leucyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 832 aa  692    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.18971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 823 aa  764    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 816 aa  846    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1884  leucyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 848 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.439942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 864 aa  688    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 971 aa  766    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 878 aa  730    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>