83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2328 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  100 
 
 		 516 aa  1014    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  56.15 
 
 		 512 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  52.3 
 
 		 518 aa  502  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  50.88 
 
 		 535 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  47.9 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  48.66 
 
 		 539 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  47.85 
 
 		 537 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  50.49 
 
 		 535 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  50.29 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  49.51 
 
 		 540 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  49.51 
 
 		 540 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  49.51 
 
 		 540 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  48.18 
 
 		 538 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  49.03 
 
 		 538 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  48.64 
 
 		 539 aa  428  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  49.51 
 
 		 511 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  46.93 
 
 		 528 aa  423  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  48.39 
 
 		 534 aa  424  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  46.21 
 
 		 530 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  46.5 
 
 		 532 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  46.74 
 
 		 534 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  44.62 
 
 		 519 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  47.24 
 
 		 522 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  43.96 
 
 		 518 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  43.55 
 
 		 519 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  47.1 
 
 		 525 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  44.02 
 
 		 529 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  43.14 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  40.82 
 
 		 519 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  42.86 
 
 		 519 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  44.02 
 
 		 512 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  43.03 
 
 		 520 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  41.51 
 
 		 519 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  41.09 
 
 		 519 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0160  transporter, putative  43.62 
 
 		 519 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  43.3 
 
 		 519 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  43.3 
 
 		 519 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  43.3 
 
 		 519 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  42.39 
 
 		 511 aa  382  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  44.2 
 
 		 519 aa  378  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  38.86 
 
 		 514 aa  349  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.76 
 
 		 508 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.76 
 
 		 510 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.76 
 
 		 510 aa  348  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328307 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  38.76 
 
 		 508 aa  348  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.76 
 
 		 508 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.91 
 
 		 508 aa  348  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  38.91 
 
 		 508 aa  348  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  38.91 
 
 		 508 aa  348  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  36.96 
 
 		 507 aa  347  4e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  37.7 
 
 		 505 aa  345  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  39.65 
 
 		 585 aa  339  8e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  36.68 
 
 		 520 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  36.61 
 
 		 508 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  37.91 
 
 		 512 aa  323  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  37.91 
 
 		 512 aa  323  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  39.88 
 
 		 523 aa  321  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  37.43 
 
 		 506 aa  317  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  36.56 
 
 		 509 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  34.77 
 
 		 552 aa  290  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0678  AbgT family protein  34.17 
 
 		 518 aa  281  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0748  AbgT putative transporter  34.17 
 
 		 518 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  38.51 
 
 		 305 aa  192  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  39.8 
 
 		 263 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1855  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter-like protein  38.1 
 
 		 88 aa  53.9  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2108  short chain fatty acid transporter  30.67 
 
 		 448 aa  53.5  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.289141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3328  hypothetical protein  30.67 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3356  hypothetical protein  30.67 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3308  hypothetical protein  30.67 
 
 		 448 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3329  hypothetical protein  30.67 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3315  hypothetical protein  30.67 
 
 		 448 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3000  short-chain fatty acids transporter  30.67 
 
 		 448 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3097  short-chain fatty acids transporter  30.67 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3110  hypothetical protein  30.67 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3467  hypothetical protein  41.27 
 
 		 240 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0456304 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3033  short chain fatty acid transporter  29.59 
 
 		 448 aa  51.6  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2249  short chain fatty acid transporter  26.99 
 
 		 440 aa  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1891  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  29.75 
 
 		 464 aa  46.6  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  27.81 
 
 		 462 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  25.25 
 
 		 500 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1419  short chain fatty acid transporter  28.87 
 
 		 434 aa  44.3  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.989346 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3052  short chain fatty acid transporter  34.57 
 
 		 457 aa  43.9  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1201  short chain fatty acid transporter  32.86 
 
 		 447 aa  43.5  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>