More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2251 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2251  uracil transporter  100 
 
 		 420 aa  813    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.447196  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0262  uracil transporter  73.75 
 
 		 421 aa  585  1e-166  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000145951  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0981  uracil-xanthine permease  66.43 
 
 		 423 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1115  uracil-xanthine permease  52.11 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  51.55 
 
 		 429 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  51.35 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  50.48 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  51.44 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  50.48 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  50.24 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  50 
 
 		 429 aa  405  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  50.86 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  50.86 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  50.86 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  50.86 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2756  uracil transporter  51.11 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.895321  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  50.86 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  50.86 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  50.86 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0910  uracil-xanthine permease  50.35 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327811 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  50.86 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  50.36 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  50.86 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  50.86 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  50.84 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  50.84 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  50.86 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1179  uracil transporter  50.86 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0295094 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2990  uracil transporter  50.6 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0485  uracil-xanthine permease  46.8 
 
 		 458 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  49.16 
 
 		 422 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  45.8 
 
 		 434 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  43.3 
 
 		 432 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  43.3 
 
 		 432 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  43.3 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  41.04 
 
 		 457 aa  328  9e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  41.73 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  42.31 
 
 		 427 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  42.07 
 
 		 427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  42.07 
 
 		 427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  42.07 
 
 		 427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  42.07 
 
 		 427 aa  306  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  42.07 
 
 		 438 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  42.07 
 
 		 438 aa  307  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  42.07 
 
 		 438 aa  307  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  42.07 
 
 		 427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  41.59 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  41.59 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  41.55 
 
 		 435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  41.55 
 
 		 435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0765  uracil permease  41.39 
 
 		 430 aa  302  7.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0460  uracil-xanthine permease  39.18 
 
 		 423 aa  292  7e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000162343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  41.55 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  40.82 
 
 		 432 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1876  xanthine/uracil permease  39.09 
 
 		 423 aa  286  4e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.355169  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  38.86 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  38.19 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  37.53 
 
 		 415 aa  273  4.0000000000000004e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  38.19 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1711  xanthine/uracil permease  40.52 
 
 		 430 aa  270  4e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  40.78 
 
 		 433 aa  266  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0490  xanthine/uracil permease  36.54 
 
 		 443 aa  266  7e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0186546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  38.3 
 
 		 403 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1089  uracil-xanthine permease  38.16 
 
 		 430 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355646  hitchhiker  0.00900914 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1416  uracil-xanthine permease  37.79 
 
 		 391 aa  259  7e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00824377  normal  0.439597 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1422  uracil-xanthine permease  36.76 
 
 		 436 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0087754  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1232  uracil permease  37.16 
 
 		 436 aa  255  8e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.011581  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0556  uracil permease  37.14 
 
 		 425 aa  252  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1629  uracil-xanthine permease  36.15 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0348661 
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  37.5 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0593  uracil permease (Uracil transporter)  35.81 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0341896  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0419  permease subfamily protein  35.99 
 
 		 411 aa  238  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3856  uracil-xanthine permease  36.06 
 
 		 414 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401696  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3008  uracil-xanthine permease  35.68 
 
 		 435 aa  237  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0672  uracil-xanthine permease  35.82 
 
 		 415 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0138  uracil-xanthine permease  34.37 
 
 		 435 aa  236  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  36.08 
 
 		 439 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  34.29 
 
 		 553 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002783  uracil permease  35.05 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  34.62 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2636  uracil-xanthine permease  34.62 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.880148  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2589  uracil-xanthine permease  34.62 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.11462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  34.62 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  34.62 
 
 		 442 aa  234  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06620  uracil-xanthine permease  36.87 
 
 		 433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2119  putative purine permease ycdG  34.38 
 
 		 442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1121  putative purine permease ycdG  34.62 
 
 		 442 aa  233  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1144  uracil permease  36.99 
 
 		 441 aa  232  8.000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00015053  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0652  uracil-xanthine permease  35.35 
 
 		 429 aa  232  8.000000000000001e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03198  hypothetical protein  34.79 
 
 		 417 aa  232  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3058  uracil-xanthine permease  35.09 
 
 		 434 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.507498  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2388  uracil permease  35.46 
 
 		 416 aa  231  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0413  uracil-xanthine permease  34.59 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4294  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  34.59 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000625543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1077  uracil-xanthine permease  34.25 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1519  uracil-xanthine permease  34.62 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  34.38 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6359  xanthine/uracil tranporter  34.66 
 
 		 435 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4298  uracil-xanthine permease  34.7 
 
 		 411 aa  230  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0402809 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3032  uracil-xanthine permease  34.16 
 
 		 435 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>