More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2248 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2248  HesA/MoeB/ThiF family protein  100 
 
 
240 aa  486  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.14 
 
 
254 aa  204  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.45 
 
 
253 aa  201  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.72262e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.8 
 
 
244 aa  197  8e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0064  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.7 
 
 
253 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0067  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.7 
 
 
253 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.46 
 
 
255 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.73518e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0550  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.48 
 
 
254 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.96 
 
 
254 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  8.13417e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.92 
 
 
242 aa  172  4e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2278  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.17 
 
 
244 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00531511  hitchhiker  7.38809e-07 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.21 
 
 
244 aa  166  3e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0002961  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.93 
 
 
252 aa  166  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.123515  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0946  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.56 
 
 
254 aa  161  8e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3117  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.49 
 
 
255 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  4.96284e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4144  hesA/moeB/thiF family protein  40.08 
 
 
255 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  2.36944e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4134  hesA/moeB/thiF family protein  40.08 
 
 
255 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  8.45686e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4296  hesA/moeB/thiF family protein  40.08 
 
 
255 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.13687e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4630  hesA/moeB/thiF family protein  40.08 
 
 
255 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  4.45557e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06440  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  38.33 
 
 
247 aa  160  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.217123 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4481  hesA/moeB/thiF family protein  40.08 
 
 
255 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.6452e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4484  hesA/moeB/thiF family protein  40.08 
 
 
255 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  6.92664e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4248  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.08 
 
 
255 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000534198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0715  hesA/moeB/thiF family protein  40.08 
 
 
255 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  9.90791e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4521  hesA/moeB/thiF family protein  40.08 
 
 
255 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.82259e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4534  hesA/moeB/thiF family protein  40.08 
 
 
255 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  7.45261e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  36.92 
 
 
255 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23710  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  41.18 
 
 
258 aa  158  9e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  3.94678e-05  normal  0.987322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.36 
 
 
242 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  35.97 
 
 
252 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7357e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.12 
 
 
255 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.66 
 
 
267 aa  155  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0619  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.71 
 
 
244 aa  152  6e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.19184 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36 
 
 
257 aa  151  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0761  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.92 
 
 
246 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.78365e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.69 
 
 
254 aa  149  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  2.51146e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.25 
 
 
258 aa  147  2e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57166e-10 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.25 
 
 
258 aa  147  2e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.12 
 
 
256 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.84 
 
 
249 aa  144  8e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.13 
 
 
246 aa  144  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.15 
 
 
253 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.67 
 
 
242 aa  140  2e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2571  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.68 
 
 
243 aa  138  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal  0.0248599 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0813  hypothetical protein  38.3 
 
 
236 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000136128  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1086  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.74 
 
 
246 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.71 
 
 
258 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0322  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  36.79 
 
 
240 aa  136  3e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1191  HesA/MoeB/ThiF family protein  36.65 
 
 
258 aa  135  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.237248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0108  HesA/MoeB/ThiF family protein  41.11 
 
 
288 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00087346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0360  HesA/MoeB/ThiF family protein  41.11 
 
 
288 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00356091  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0905  HesA/MoeB/ThiF family protein  41.11 
 
 
288 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0660  HesA/MoeB/ThiF family protein  41.11 
 
 
288 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0996044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1062  HesA/MoeB/ThiF family protein  41.11 
 
 
341 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2495  HesA/MoeB/ThiF family protein  41.11 
 
 
288 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1313  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.1 
 
 
275 aa  132  4e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
286 aa  132  7e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.6 
 
 
269 aa  130  2e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2615  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
285 aa  130  2e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.17 
 
 
273 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1686  hypothetical protein  34.54 
 
 
257 aa  129  5e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  3.36589e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.11 
 
 
285 aa  129  5e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1719  hypothetical protein  34.54 
 
 
257 aa  129  5e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00168619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
285 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0742  ThiF family protein  41.11 
 
 
285 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.441652  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
285 aa  128  7e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0718  HesA/MoeB/ThiF family protein  40.56 
 
 
288 aa  128  7e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0036619  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.62 
 
 
277 aa  128  8e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.33 
 
 
261 aa  128  9e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.32 
 
 
264 aa  127  1e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  36.72 
 
 
268 aa  127  1e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0902  HesA/MoeB/ThiF family protein  40 
 
 
288 aa  127  1e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.23 
 
 
263 aa  127  2e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  35.08 
 
 
269 aa  127  2e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.72 
 
 
268 aa  127  2e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  36.72 
 
 
266 aa  127  2e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  36.72 
 
 
268 aa  127  2e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  36.72 
 
 
268 aa  127  2e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.72 
 
 
268 aa  127  2e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  36.72 
 
 
268 aa  127  2e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  36.72 
 
 
268 aa  127  2e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  37.08 
 
 
268 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  37.08 
 
 
268 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  37.08 
 
 
268 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  37.08 
 
 
268 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  37.08 
 
 
268 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.67 
 
 
237 aa  125  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.183902  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  35.96 
 
 
272 aa  125  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0542  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.63 
 
 
264 aa  125  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  36.51 
 
 
277 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.76 
 
 
295 aa  125  8e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.44 
 
 
285 aa  125  8e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5899  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.89 
 
 
285 aa  124  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1956  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.44 
 
 
285 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3958  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2567  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.44 
 
 
285 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.64 
 
 
268 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  5.33838e-05  hitchhiker  5.27658e-07 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.45 
 
 
270 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.45 
 
 
262 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.333296 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.69 
 
 
259 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35994e-07 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3397  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.39 
 
 
275 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.056672  normal  0.0184534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>