17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2206 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2206  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  300  3.0000000000000004e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292408  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1754  hypothetical protein  32.62 
 
 
130 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  32.97 
 
 
155 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  33.09 
 
 
137 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0709  hypothetical protein  32.62 
 
 
130 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0149  hypothetical protein  32.62 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.104212  normal  0.0128163 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  30.71 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  30.5 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  31.62 
 
 
147 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1865  hypothetical protein  38.04 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000298888  normal  0.822078 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  37.31 
 
 
563 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  30.83 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  31.36 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  29.41 
 
 
580 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  29.41 
 
 
580 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  29.1 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0452  hypothetical protein  26.81 
 
 
138 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.265076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>