More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2202 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2202  membrane protein  100 
 
 
296 aa  577  1e-164  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.32 
 
 
294 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  33.86 
 
 
287 aa  122  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  32 
 
 
287 aa  122  8e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  31.34 
 
 
303 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  31.13 
 
 
287 aa  115  7e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  30.99 
 
 
303 aa  115  8e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.6973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  34.13 
 
 
304 aa  114  1e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  33.73 
 
 
304 aa  115  1e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.55461e-07 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  34.13 
 
 
304 aa  114  2e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  34.13 
 
 
304 aa  114  2e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  32.94 
 
 
303 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  33.73 
 
 
304 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  31.07 
 
 
299 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  32.94 
 
 
304 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.88959e-05 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  31.07 
 
 
299 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  30.47 
 
 
299 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.3 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  31.54 
 
 
299 aa  99  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2709  EamA family protein  30.95 
 
 
304 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00270641  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6058  hypothetical protein  29.96 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5832  hypothetical protein  30.07 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.684234 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0098  hypothetical protein  31.18 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0094  hypothetical protein  31.18 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  28.21 
 
 
294 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 
287 aa  89.4  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  3.80606e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  30.48 
 
 
294 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  28.47 
 
 
294 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.46 
 
 
289 aa  85.1  1e-15  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  32.79 
 
 
307 aa  84.7  2e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  27.06 
 
 
296 aa  84.3  2e-15  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  27.84 
 
 
294 aa  84.3  2e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  29.58 
 
 
294 aa  84.7  2e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  29.93 
 
 
296 aa  84.3  2e-15  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  28.47 
 
 
294 aa  83.2  4e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  28.47 
 
 
294 aa  83.2  4e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0112  hypothetical protein  28.72 
 
 
298 aa  83.2  4e-15  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  28.62 
 
 
312 aa  83.6  4e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  27.87 
 
 
296 aa  83.2  5e-15  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 
295 aa  82.4  8e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.503688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  28.91 
 
 
294 aa  81.6  1e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  28.72 
 
 
299 aa  81.3  2e-14  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  27.46 
 
 
305 aa  80.5  3e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  29.12 
 
 
305 aa  80.1  4e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.64 
 
 
311 aa  80.1  4e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  28.62 
 
 
299 aa  79.7  5e-14  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  27.92 
 
 
295 aa  79.3  8e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  26.81 
 
 
311 aa  78.2  1e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  31.37 
 
 
303 aa  77.8  2e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  31.37 
 
 
303 aa  77.4  3e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  27.27 
 
 
294 aa  77.4  3e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  31.73 
 
 
303 aa  76.6  5e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  31.37 
 
 
303 aa  75.9  7e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  31.37 
 
 
303 aa  76.3  7e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  30.69 
 
 
303 aa  75.9  7e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10425e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.37 
 
 
299 aa  75.9  8e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  31.37 
 
 
303 aa  75.9  8e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  31.62 
 
 
303 aa  75.1  1e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  31.37 
 
 
303 aa  75.5  1e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.48571e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  31.37 
 
 
303 aa  75.5  1e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.76936e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  27.15 
 
 
294 aa  74.7  2e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1521  hypothetical protein  30.26 
 
 
266 aa  73.9  3e-12  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.851073  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  25.74 
 
 
299 aa  73.9  3e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  29.48 
 
 
313 aa  74.3  3e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  26.88 
 
 
310 aa  73.2  5e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  25.25 
 
 
292 aa  73.2  5e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  28.86 
 
 
283 aa  72.4  1e-11  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 
310 aa  71.6  1e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  27.81 
 
 
293 aa  72  1e-11  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  25.27 
 
 
310 aa  71.2  2e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  27.97 
 
 
307 aa  71.2  2e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  25.44 
 
 
328 aa  71.6  2e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  25.98 
 
 
310 aa  71.2  2e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  25.27 
 
 
310 aa  70.5  3e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25.6 
 
 
312 aa  70.5  3e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  26.8 
 
 
319 aa  70.1  4e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  29.24 
 
 
300 aa  69.7  5e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
292 aa  69.7  6e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  24.48 
 
 
274 aa  69.7  6e-11  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  27.01 
 
 
305 aa  69.7  6e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.62 
 
 
315 aa  69.3  8e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  25.34 
 
 
310 aa  68.9  8e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  23.21 
 
 
302 aa  68.6  1e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  25.61 
 
 
293 aa  68.6  1e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3075  EamA family protein  27.76 
 
 
294 aa  68.6  1e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 
300 aa  68.6  1e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  25.18 
 
 
308 aa  68.6  1e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  28.57 
 
 
301 aa  68.6  1e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.59 
 
 
302 aa  68.6  1e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.943556  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  26.04 
 
 
306 aa  68.2  2e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  24.91 
 
 
290 aa  67.4  3e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  27.57 
 
 
298 aa  67  4e-10  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 
301 aa  66.6  5e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.56 
 
 
310 aa  66.2  7e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 
315 aa  65.9  7e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0463  hypothetical protein  27.91 
 
 
289 aa  65.9  9e-10  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 
325 aa  65.9  9e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 
301 aa  65.5  9e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25.7 
 
 
306 aa  65.5  1e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>