115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2131 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2131  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 
197 aa  389  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2474  cobalt transport protein CbiM  48.48 
 
 
201 aa  171  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2022  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.14 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000920884  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3436  cobalt transport protein CbiM  39.3 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.790482  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1959  cobalt transport protein CbiM  35.12 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0273  cobalt transport protein CbiM  41.03 
 
 
231 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163023  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1190  cobalt transport protein CbiM  37.2 
 
 
204 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000465772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.84 
 
 
430 aa  94  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3138  cobalt transport protein CbiM  33.33 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1951  cobalt transport protein CbiM  33.01 
 
 
211 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1346  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.6 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0137458  unclonable  0.00000105881 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3139  cobalt transport protein CbiM  37.37 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1365  cobalt transport protein CbiM  35.78 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1321  cobalt transport protein CbiM  35.78 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0171  cobalt transport protein CbiM  39.9 
 
 
194 aa  89  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1133  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.05 
 
 
198 aa  88.6  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.540876 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3500  cobalt transport protein CbiM  29.9 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2782  cobalt transport protein CbiM  30.95 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104857  decreased coverage  0.00186647 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0756  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32 
 
 
204 aa  82  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.535261  normal  0.785347 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0543  cobalt transport protein CbiM  30.77 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0557  cobalt transport protein CbiM  31.28 
 
 
195 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.583466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.14 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00179951  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3207  cobalt transport protein CbiM  30 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1471  cobalt transport protein CbiM  32 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.699456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.64 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  28.77 
 
 
321 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3947  cobalt transport protein CbiM  30.48 
 
 
205 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  28.29 
 
 
212 aa  62  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  39.47 
 
 
226 aa  61.2  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.11 
 
 
216 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.31 
 
 
333 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  29.63 
 
 
256 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.76 
 
 
328 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  29.58 
 
 
245 aa  58.9  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  29.11 
 
 
251 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  27.94 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  26.47 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30.66 
 
 
232 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.57 
 
 
246 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1936  cobalt transport protein CbiM  32.66 
 
 
204 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  40.87 
 
 
226 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  27.32 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  35.96 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.56 
 
 
235 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  26.73 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1292  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.11 
 
 
299 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.800906 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1402  cobalt transport protein CbiM  27.67 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30 
 
 
326 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  28.44 
 
 
231 aa  52  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.85 
 
 
241 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.85 
 
 
241 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.13 
 
 
421 aa  51.6  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  35.88 
 
 
339 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000340042  normal  0.0123253 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.59 
 
 
213 aa  51.2  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.37 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  27.7 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  26.24 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  39.34 
 
 
249 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30.54 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.56 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  27.4 
 
 
229 aa  48.9  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  29.22 
 
 
225 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.97 
 
 
219 aa  48.9  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0927  cobalamin biosynthesis protein CbiM  33.1 
 
 
250 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2145  cobalt transport protein CbiM  29.3 
 
 
235 aa  48.9  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0808457  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  35.83 
 
 
247 aa  48.5  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  29.55 
 
 
235 aa  48.9  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  29.22 
 
 
225 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  35.83 
 
 
247 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  29.22 
 
 
225 aa  48.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  27.8 
 
 
231 aa  47.8  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  24.53 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.51 
 
 
352 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.7 
 
 
242 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  25.39 
 
 
202 aa  47  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  29.41 
 
 
250 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.07 
 
 
307 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0543  cobalamin biosynthesis protein CbiM  29.07 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.7 
 
 
355 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3837300000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.2 
 
 
310 aa  46.2  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.36 
 
 
233 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.57 
 
 
232 aa  45.4  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.4 
 
 
218 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2033  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.41 
 
 
217 aa  45.1  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2793  cobalt transport protein CbiM  35.54 
 
 
226 aa  45.1  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3660  cobalt transport protein CbiM  34.17 
 
 
225 aa  45.1  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  25.71 
 
 
235 aa  45.1  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  27.96 
 
 
225 aa  44.7  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  36.52 
 
 
352 aa  44.7  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.31 
 
 
232 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1327  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.5 
 
 
229 aa  44.7  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.31 
 
 
232 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.31 
 
 
232 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  27.78 
 
 
599 aa  44.3  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.83 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2601  cobalt transport protein CbiM  36.67 
 
 
246 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184682  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  36.25 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1226  cobalt transport protein CbiM  36.36 
 
 
226 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00004415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  36.36 
 
 
226 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>