59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2113 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  482  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  30.77 
 
 		 964 aa  97.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  29.71 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  27.12 
 
 		 998 aa  92.8  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  30.14 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  27.9 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  28.96 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  30.21 
 
 		 972 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  31.3 
 
 		 977 aa  89  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  25.23 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  30.53 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.87 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  29.59 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.99 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  26.72 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  26.13 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  27.22 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  29.05 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  27.22 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  26.05 
 
 		 242 aa  72  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  26.96 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  30.29 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  31.29 
 
 		 891 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  30.81 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  25.96 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  27.18 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.52 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  22.71 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  25.64 
 
 		 253 aa  62  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  27.11 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  26.67 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  29.73 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28.74 
 
 		 748 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  21.81 
 
 		 770 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 768 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  30.18 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  26.48 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  30.77 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  26.46 
 
 		 736 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 234 aa  52  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  22.16 
 
 		 270 aa  52  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  22.58 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  24.21 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 		 372 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  26.83 
 
 		 916 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  22.73 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 371 aa  42.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  26.97 
 
 		 911 aa  42  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>